事情并没有到此就结束了。
第二天, 内阁收到了御史顾慥弹劾熊廷弼的折子。折子内容写的很犀利，用刘时敏整理出来的白话就是“熊廷弼出关一年有余，诸事没有规划;蒲河失守，隐瞒消息不上报;带着兵器的战士不用于作战, 只用来挖沟，尚方宝剑在手不求有补国事，只是供自己作威作福。”
御史冯三元也同时上折子弹劾廷弼八件没有谋略的表现, 三件欺瞒皇帝的事。还在折子里明确地表示不罢免熊廷弼，辽地最终将无法保住。
御史张修德上奏章弹劾熊廷弼的修筑城墙等举措，破坏辽东重镇襄平。
兵科给事中魏应嘉也上折子弹劾熊廷弼在辽东所为。
方从哲前一晚已经得到刘时敏转告新君对熊廷弼经略辽东的态度，也得知了新君的处理意见, 就利用首辅的权利, 直接把几人的封还。
这一下子可就算是捅马蜂窝了。
姚宗文没想到自己好容易主持的弹劾熊廷弼行动，居然被内阁首辅封还了折子。他立即把弹劾熊廷弼的矛头指向了首辅方从哲。
朝臣应者云集。
弹劾的内容集中在方从哲应该为萨尔浒战败负责，应该为光宗死于红丸案负责, 应该为这几年他做首辅期间朝政败坏、官员缺失、吏治不清负责,
桩桩件件指责的言外之意就是首辅方从哲已经是大明的罪魁祸首，是坏了大明根基的十恶不赦之徒，应该族诛以谢辽东那几万死亡的将士。
同时被拉出来弹劾的还有前辽东经略、正在诏狱待审决的杨镐、另外就是仍在兵科任职的给事中赵兴邦。
已经在三个月前做出了定论的萨尔浒战败案, 又被别有用心之人掀开了。
弹劾熊廷弼的奏折被方从哲封还了，但是弹劾他自己的, 他就无能为力了, 还得让内阁主事把弹劾自己的折子放在专门的箱子里, 一个不缺地送去司礼监。
刘时敏在养心殿收到这些弹劾首辅的折子, 依着天子的吩咐，把弹劾这些人的折子登记在一张大纸画就的表格上。然后发现这些人弹劾的内容虽然不同，总结起来还就那么几条，上折子的人间隔交叉弹劾意见，很明显是有谋划的行动。
“朕算是明白太/祖为什么喜欢廷杖了。这些人明显就是勾结在一起，为邀名不顾朝廷利益呢。”
朱由校啧啧有声。
“时敏，等登基大典完成后，朕立即把这些人打一顿如何？”
刘时敏摇头，“皇爷，那就成全了他们想记入史册的痴心妄想。”
朱由校点头，“说的有道理，但是不打他们一顿，真是难消心头这口气。这些人整天政事不干，只会张口咬人。贬官吧，他们回乡就编排朝廷的不是。你看看杨涟、左光斗居然也掺和进来了。这可让朕失望了啊。你去催催户部尚书，看看他那里献田、隐户统计弄出来没有。”
刘时敏躬身行礼，然后去户部找李汝华。他隐约揣摩出来天子的意思，是想要看参与弹劾的官员是不是有违法之事。
方从哲受不住四面八方针对他的弹劾来向朱由校递交辞呈。
“陛下，老臣闲适在野十五载，本已无意仕途了，但不得不应召重回朝廷。这七年殚精竭虑，与神宗是未能清扫了建奴威胁的不合格首辅；与先帝，唉，先帝遗命老臣保李选侍，老臣愧疚。”
朱由校冷笑，“你愧疚什么？要不要为孝和太后报仇，朕自有主张。难道你认为李选侍不该死吗？”
“陛下，她到底是你的庶母。”方从哲不甘心。
“自然重不过此身的生母份量。”
朱由校凉凉地回答方从哲。心里纳闷李选侍死了几日了，早凉透了，方从哲这个首辅到现在再与自己纠缠李选侍之死，有什么意义吗？
“陛下，先皇一度要封李选侍做贵妃、皇贵妃的，其心愿是要保李选侍的。忽视父亲的心愿亦是不孝。”
“呵呵，那李选侍按照宫规早该死了。是先帝昏聩，纵容其不法罢了。”
“子不言父过。陛下。”
方从哲对着朱由校殷殷劝解。
“朕是文盲，不懂你说的这些话。朕知道杀人偿命欠债还钱。”
方从哲被“文盲”噎得一口老血梗在喉咙处。陛下，你就是以文盲自居也多少像样子一点儿吧，你拿着杨涟和左光斗的折子，看得津津有味的，哪里是一个“文盲”能有的做派。
朱由校从方从哲的表情看出他的内心所想，立即把手里的折子倒过来。把老先生气得胡子都翘起来了。
“陛下，老臣如今继续恋栈首辅的位置不去，对朝廷百害无一利。请陛下允许老臣辞官回乡。”
“不准。内阁还缺人干活呢。你可别给朕玩生病那一套啊。户部的献田隐户表格，你填写了没有？”
方从哲立即没了生气。
“陛下，这天下秋闱得中的举人，有几个没接受献田和投靠的。”
“那就是说取消举人的减免赋税田亩数目、和免徭役的人口数，就能够增加太仓的赋税了？你这主意好。就这么干了。”
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