一件最核心的案子在浮出水面时总要有很多掩饰，或人或事件总会混淆视听，但实际上，随着这些足以掩人耳目的小案件的浮现，最重要的信息也许早就示于人前了，只不过，事件太杂线索太多，蒙蔽了人的双眼而已。这些道理，有着多年办案经验的罗池明白，与死人为伍的陆北辰也明白，所以，在接二连三的线索并头时，他们要做的就是梳理再梳理，除去看似对案情有关实则只是鱼目混珠的信息，留下最核心的那个。
罗池对案情，从一开始到现在，重新做了梳理和分析，并且最终将温泉碎尸案、整形机构和餐厅违规操作、绑架案合并一起，定义为“青灯木偶”案。因为他们发现，在整个案件系统中，最终的目的就落在那一盏青灯和一个木偶身上。
跟所有的案件一样，这起“青灯木偶”案在浮出水面时总会有先兆出来。他们最先在温泉池中发现了被人抛弃的尸体，两具被人十分巧妙拼凑成一具尸体的尸体。于是，警方介入，法医介入，各个部门开始投入对这件案子的调查之中。陆北辰通过尸检确定了死者的信息，警方根据信息找到了死者居住地。陆北辰根据现场的血迹和细枝末节的线索给出凶手的特征，并且随同罗池去了庞城的老家。
在这个先头案件中，有利的线索是凶手的作案手法和目的，可以确定的是，沈强杀了庞城，凶手杀了沈强，并且将两人的尸体拼凑成一具尸体，经法医这边的检测得知，庞城的头盖骨与沈强失去头盖骨的弧度大小惊人的吻合，那么问题来了，拼凑一具尸体的做法是凶手临时构想还是早就有所谋划？庞城是知道了什么秘密而被人灭口还是说，对方只想要他的头盖骨？而在追踪这个案子的其他线索中，庞城在老家的那些信息以及为了达到富家的目的威胁县长等等已不再重要，它们不过是可以确定庞城身份的辅助线索而已。
在确定庞城身份时，那位给庞城动过手术又离职的医生是关键，后来经证实，他到整形机构坐诊也不过是拿人钱财，对于整形机构里的内情他一概不知。而庞城动手术的原因也没什么好怀疑的，庞城有头疾的毛病，而那位医生又是治疗头疾的专家，庞城出得起钱，自然请得起专家为他开刀。
而罗池根据盛天伟的口供，依照时间来推算，许桐收到青灯和木偶的时间远远早于温泉碎尸，陆北辰推算沈强的死亡时间同庞城一样，从发现尸骨那天再往前推半个月。换句话说，许桐是在沈强还没被害前收到了一盏青灯和会念童谣的木偶，而收到青灯木偶后的没多久沈强就遇害了，可那时盛天伟不知情，得知许桐在被人恐吓后第一个想到的就是有前科的沈强，他便去了沈强的旧址。而许桐的尾随，也足可以说明那个时候沈强是刚刚遇害，许桐向来观察仔细，尾随盛天伟之后第一次去到沈强家，从摆设和灰尘情况看得出沈强是离家不久，只是，他们根本不知道那时候沈强已经死了，而且，就死在自家的浴池里。
在处理温泉案的过程中，许桐接二连三受到恐吓，甚至还发生了花盆砸落和弄堂蓄意谋杀事件，这是同时进行的，只不过那时候盛天伟没有选择与警方合作，关于许桐的事罗池他们到了后来才得知。在时间的比对上，罗池与陆北辰达成了一致，那就是，沈强出狱后就很安分守己，一直在外滩汇工作，就职的短短几个月，他就被调到北京委以重任。
说起沈强，算是个难得的人才，这点就连盛天伟也承认。沈强没入狱前曾在跨国集团就职，他主攻技术，所以往往出成绩而少人际交往，不论从职业还是从外形条件来看，都跟眉首称得上是一对璧人。只是眉首失踪后他就变得阴郁闭塞，以至于走上了极端。出狱后有了案底不好找工作，听说外滩汇那份工作是戚娇娇主动招他的。让一个从事技术的人去从事餐厅工作有点奇怪，但戚娇娇对警方说的是，当时沈强的简历是职业中心推荐上去的，她并不知道沈强有案底，沈强来餐厅工作后人勤快，工作能力又很强，所以她就没找人去查他的情况。
陆北辰否认沈强是恐吓许桐的凶手还有一个重要原因，那就是在沈强的旧址中发现了一些陈旧的青灯，从外形和物料的陈旧情况来看，那些青灯是有了一定年头，排算时间，应该是他入狱前做的，也就是说，那些陈旧的青灯是他打算再用来吓人的，不成想还没继续用上就入了狱。而许桐收到的青灯是新的，如果是沈强，一来不会放木偶，二来会直接用旧灯就好。
盛天伟将工作重点落在了北京，对外声称方便业务往来，实则是想暗中保护许桐，他一直怀疑沈强，因为不论是装神扮鬼还是饮品中下毒，这都是沈强能做出来的事。与此同时，外滩汇和整形机构违规操作一事终于东窗事发，而由头就是那起餐厅枪击案。
看似一件与温泉案毫无关系的枪击案，实际上却把餐厅负责人戚娇娇给翻了出来，而对戚娇娇痛下杀心的服务员平日里与沈强交好，据他的口供，他认为沈强的“失踪”与戚娇娇脱不了干系。后来他给警方的口供是，沈强“失踪”前已经与戚娇娇的关系闹得很僵了，甚至有一次在员工大会上沈强与戚娇娇有过争执，原因是当时戚娇娇当着所有人的面说了沈强一句：你算什么东西。这句话激怒了沈强，而戚娇娇平日里对员工的态度就差，对沈强说了句：像你这种人就直接死了算了。
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