亲眼目的同伴被二草一杀死的二草十七，因为过度伤心昏厥过去。在那之后，二草十七就开始刻意回避二草一，让二草一对自己的行为大为懊悔。
不过开弓没有回头箭，大巫女既然不仁，那二草一也就不义了。她彻底控制了三草，并对邪巫女组织进行彻底的改组，其中最大的改变莫过于据点的迁移。
二草一将据点迁到了现在黑神社的位置，开始修建要塞。她向里弥神社隐瞒了二草一系几乎全灭的事情，以及据点迁移的事情，并在下一次物资交接时向大巫女提出“需要更多武器装备”的要求。
一开始大巫女没有察觉到二草一的动作，后来大巫女发现邪巫女组织似乎越来越不听话了，甚至还敢袭击里弥神社庇护下的村庄，她这才意识到二草一已经脱离了她的控制。好在大巫女早就留了后手，邪巫女组织没有自产武器装备的能力，也没有合适的销赃渠道，因此她们对里弥神社有着极大的依赖性。
因此即便是二草一已经脱离了大巫女的控制，邪巫女依然要和里弥神社进行物资交易，只不过交易时双方的身份变得完全对等了而已。
再后来二草一建立了黑神社，自封大巫女，又创立了一系列制度。里弥神社的大巫女陆续又派了几批巫女到黑神社来，想要夺回邪巫女的控制权，结果被派过去的人反倒变成了黑神社的骨干力量。
经过几十年的发展，黑神社和邪巫女组织才变成了如今的模样。
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