太子出奔，亡命天涯。
李重俊率东宫私兵百骑出城，将欲逃奔终南山；及至鄂县之西，回顾随行者仅余数人而已。因失魂落魄，又兼人困马乏，遂入路旁林中暂憩，放马啃青。
正当疲极入梦之际，未料那随行数人，却是上官婉儿早在东宫所置卧底间谍，便趁太子熟睡，轻轻一刀杀死，复一刀割下头来，持其首级还都，回去向上官昭容报功。
至此，参与谋反诸人包括太子在内皆死，一场叛乱就此平定。
中宗此时早被杨再思等迎回太极殿中，升座以待。因见太子被诛，喜怒交迸，遂以亲子之首献祭太庙，复祭武三思、武崇训父子之柩，然后悬于午门之外示众。
既将太子悬首示众，犹不肯罢休，且复效母后武皇之举，复改成王李千里一族姓曰“蝮氏”，将其同党皆命诛杀。
更追赠武三思太尉、梁宣王，武崇训开府仪同三司，鲁忠王。
太子乱平，中宗为示庆贺，乃诏命自加尊号为“应天神龙皇帝”，韦后号曰“顺天翊圣皇后”，命改玄武门为神武门，楼为制胜楼，以志平灭太子之喜。
此举一出，满朝文武皆都惊讶。
便有人道：当今天子雄武，颇有武皇太后之风。
另有人问：公何为此言？
那人答曰：武皇太后喜加尊号，今上效之；太后喜垂帘听政，今皇后法之；太后以杀亲子为乐，今上则之。岂不谓颇有武皇之风？
后者又问：则武皇太后善用人才，耀武四边，诸夷宾服；又善纳谏，许群臣廷折逆奏，今上何不效之耶？
前者答曰：是今上还都日促，尚未学全也。别处皆未学会，然以诛杀亲子为喜，反倒学个十足十耳。
李重俊谋反既败，中宗怒犹未息，更命右台御史大夫苏珦究治其党，必要全部揪出，连根拔除。制诏二狱囚犯闻之，为脱罪立功，便有信口攀扯，并诬引相王李旦者。
苏珦恐此诬状落入韦氏同党之手，必成罗织冤狱，于是密奏天子，为相王申理冤枉。
中宗看在同胞兄弟面上，便从其奏，因此不问。
然而安乐公主及宗楚客等人，日夜密谋欲除相王，复使侍御史冉祖雍诬奏，说相王及太平公主皆与李重俊通谋，请将二人收付诏狱。皇后亦在旁侧煽风点火，必除二敌不可。
中宗阅览冉祖雍奏章，本来尚不以为意，但终经不住贤妻爱女两面夹攻，便即准奏，并命御史中丞萧至忠鞫审此案，务必得其罪状呈报。
萧至忠不肯奉命，反入内泣奏：陛下富有四海，且不能容一弟一妹，而非使人罗织陷害至其死乎？相王昔为皇嗣之时，曾坚请太后以帝位让予陛下；太后不许，相王便累日不食，此事海内所共知者，陛下奈何因奸贼冉祖雍一言，便疑同胞之亲！
又有右补阙吴兢，亦上疏道：自文明以来，国之祚胤不绝如线；陛下龙兴，恩及九族，求之瘴海，升之阙庭。况相王同气至亲，六合无贰，而贼臣日夜连谋，乃欲陷之极法；祸乱之根，将由此始。夫任以权则虽疏必重，夺其势则虽亲必轻。自古委信异姓，猜忌骨肉，以覆国亡家者，几何人矣！况国家枝叶无几，陛下登极未久，而一子以弄兵受诛，一子以愆违远窜，惟余一弟朝夕左右。尺布斗粟之讥，不可不慎，《青蝇》之诗，良可畏也！
中宗触动天良，遂许不再追究。此也是相王李旦平素宽厚恭谨，安恬好让，故经武皇、韦后之世，竟免于难。
太子被悬首午门，尸弃长街多日，群臣上朝往来见之，无不为之心酸。东宫僚属为求自保，无有一人敢近太子尸身者。
示众七日之期结束，永和县丞宁嘉勖至午门之外，搬梯摘取太子首级，坐地号哭半日，然后解衣裹之，请人缝合尸腔，运出城外葬之。
中宗闻报不悦，诏命贬其为兴平县丞。然而朝廷百官，皆因宁嘉勖而自愧不如。
韦后与安乐公主不肯罢休，奏请凡太子所经诸门守将，皆应坐罪诛杀，家属流放边州。中宗拗不过妻女，更命法司推断。
大理卿郑惟忠奏道：大狱始决，人心未安，若复有改推，则反仄者众矣。
中宗览奏，乃命止推。兵部尚书宗楚客、太府卿纪处讷必欲趁此打击政敌异己，遂复举奏告发：中书令魏元忠与太子通谋，请夷其三族。
中宗览奏，思及魏元忠大功，遂诏其以齐公致仕，朔望之日仍可上朝。
九月丁卯，叙论平灭太子叛乱之功。以吏部侍郎萧至忠为黄门侍郎，兵部尚书宗楚客为左卫将军，兼太府卿纪处讷为太府卿，并同中书门下三品。
庚子日，宣布大赦天下，改元景龙。
宗楚客举荐右卫郎将姚廷筠为御史中丞，又唆使其劾奏：当初侯君集乃为开国公侯，社稷元勋，功劳不可谓不大。然及其谋反，太宗就群臣乞其命而不得，竟流涕斩之。其后房遗爱、薛万彻、齐王李佑等为逆，虽复懿亲，皆从国法。魏元忠功不逮君集，身又非国戚，与李多祚等谋反，男入逆徒，是宜赤族污宫。但有朋党饰辞营救，以惑圣听，陛下仁恩，欲掩其过。臣所以犯龙鳞、忤圣意者，正以事关宗社耳。
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