不过大家都已经有些习惯了，毕竟从刺客之魂系列开始就是这样，硬核的动作游戏难度是高的，机甲少女对比起刺客系列来说已经算比较简单的了，换成刺客之魂还不知道要打多久。
于是在击败最终BOSS潘多拉之后，机甲少女的故事终于来到了终点。
被击败之后的潘多拉羽毛统统折断粉碎，身体残缺不全，她落到地上的时候，众人能清晰看到在她的身体当中有一个闪烁着紫色光亮的魔盒在闪烁着光芒。
“啧啧，没有想到潘多拉的身体里面居然真的有一个魔盒。”梓雨开心地笑了起来。
在希腊神话传说当中，潘多拉是赫菲斯托斯用粘土做成的第一个女人，作为对普罗米修斯盗火的惩罚，送给人类的第一个女人。
众神赠予她使她拥有更诱人的魅力的礼物，火神赫菲斯托斯给她做了华丽的金长袍，爱神阿佛洛狄忒赋予她妩媚与诱惑男人的力量，众神使者赫耳墨斯教会了她言语的技能。
神灵们每人给她一件礼物。
宙斯给潘多拉一个密封的盒子，里面装满了祸害、灾难和瘟疫等，让她送给娶她的男人。
普罗米修斯深信宙斯对人类不怀好意，告诫他的弟弟埃庇米修斯不要接受宙斯的赠礼。
可他不听劝告，娶了美丽的潘多拉。
埃庇米修斯被好奇心驱使，打开了那只盒子，立刻里面所有的灾难、瘟疫和祸害都飞了出来。
人类从此饱受灾难、瘟疫和祸害的折磨。
而智慧女神雅典娜为了挽救人类命运而悄悄放在盒子底层的美好东西“希望”还没来得及飞出盒子，惊慌万分的潘多拉就把盒子关上了。
后来潘多拉魔盒被众神永远封锁。
制作组用潘多拉作为最终BOSS的名字，其实是有深意的。
“人类，或者说未来的我们。是多么自私又残暴的生物。”潘多拉笑着说，“曾经我也是一个人类啊。”
在她说话的同时，众人看到潘多拉的身体在不断变化着，从之前那个华丽高大的机甲慢慢向内坍缩，最后变成了一个黑眸黑发的少女模样。
“卧槽！潘多拉居然也是个机甲少女？”
“应该是吧，而且按照她的说法来看，估计机甲少女们之前也都是人类，只不过不知道什么原因拥有了变身成为机甲的力量。”
“果然跟我想的差不多，之前制作组埋下的伏笔已经相当明显了啊，估计现在的机甲少女们跟他们对抗的敌人都是同一个物种。”
后面的一段CG就是用来讲述机甲少女以及机甲怪物的起源的：
在很久很久以前，人类战争进入到了无法控制和约束的状态，而且地球人想要通过研发新的武器占领其他星球。
于是人类为了发动战争，秘密研究了这种机甲型的战争武器，最后却因为一些问题导致失控。
起源的那个可以将人类变成拥有超强破坏力的能量盒被研发者们称为魔盒，因为最开始研发它的人在创造出了这个东西之后立刻意识到了它可能给世界带来的危害，觉得是一种不祥之物，想要销毁它，可惜没有来得及就被杀死，魔盒流落到了一些心怀叵测的人手里。
他们用魔盒进行实验，创造了许多机甲型的怪物。
这些机甲型的怪物原本都是人类，只不过因为遭受到了魔盒的能源辐射之后才变成了这种可怕的模样。
而变成机甲怪物之后的【人类】却因为大脑无法负荷这些强大的能量于是陷入了疯狂，对人类以及整个宇宙进行无差别的攻击，成为了人类的噩梦。
许多人类建造的星球都被其摧毁，他们把这些机甲怪兽称为多穆雷，意思是毁灭灾厄。
但是在被改造的那些机甲怪物当中，有这样一批实验者能够在机甲和人类的形态之间来回切换，而且还能保持着足够的理智。
这些人，无一例外都是一些年轻的少女，或许是因为她们本身体内有某种特殊的基因导致跟魔盒能量源结合的时候产生了这种奇妙的变化。
唯一的缺点在于，变成机甲形态的少女们无法对机甲本身进行操控，而需要一个跟她们匹配的驾驶员才能让机甲的作用发挥出来。
这些驾驶员不分男女，可以在剩下的人类当中进行挑选。
至此当时的人类认为他们制造出了一种完美的兵器。
直到这一天，一个名为X的机甲少女诞生，她不但能变身成为机甲，同时不需要任何的驾驶员进行操作，自己就能独立完成作战的工作。
X还拥有一种特殊的能力，她能通过脑电波控制和引领其他的怪兽，被当时的人类指挥官视为人类最大的希望，只要拥有了X，就能控制整个世界。
于是野心勃勃的指挥官利用X进行各种星际扩张，屠杀掉了无数行星上的智慧生命，让人类的火种扩张到宇宙当中无数个角落。
可这个叫做X的少女因为了解到了真相，不甘于被那些权位上的人当成工具进行操控于是逃离了星球，在这之后，她通过召集和控制其他的机甲怪兽，组建了一支浩荡的机甲怪兽队伍，对人类进行了报复。
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