小智一行人坐在拉普拉斯的背上继续着他们橘子群岛的旅行。
突然，小建像是发现了什么东西：“咦？那个是？”游近后，原来是个漂流瓶，拉普拉斯将漂流瓶叼起来，给小智，小智对拉普拉斯说道：“谢谢你啦，拉普拉斯。”小霞好奇地凑过来看了看小智手中的瓶子，说道：“里面有一封信呢！”小建猜测道：“也许是附近哪个岛上的居民丢出来的吧。”小智翻开信后，读道：“我看看啊，上面写着：如果有谁知道水晶大岩蛇这个宝可梦的话，请你一定要告诉我，万事拜托了。椪柑岛的正美。”
小霞听完，歪着脑袋问：“水晶大岩蛇？”小建解释道：“应该就是全身都是水晶组成的大岩蛇。”小霞还是不相信：“有这种宝可梦吗？”小建不太确定地说道：“不知道，不过好像有人曾经看到过。”
小智建议道：“我们先去椪柑岛吧，也许水晶大岩蛇就在那里，如果真的有水晶大岩蛇的话，这么稀有的宝可梦我是必须收服的。”他对这只水晶大岩蛇非常感兴趣，这应该是在原剧情中小智碰到的第一只因实际环境所造成的基因突变形成的宝可梦。就这样，在小建的指路下，小智一行人就朝椪柑岛的方向前进。
登陆椪柑岛后，小智收回拉普拉斯，让它休息一下。小霞看着琳琅满目的玻璃制品看花了眼。小建为小霞介绍说：“椪柑岛这里是以玻璃工艺品着称的，岛上大部分的居民都是制作玻璃工艺品的师傅，所以来这里的游客也特别多。”小智迫不及待地对小霞和小建说：“我要先去找水晶大岩蛇，你们要一起去吗？”小霞自然是跟着一起去了：“你真要去啊？我也跟着一起去好了。”小建也没什么特别要做的事：“我也跟着一起去吧，你们要找水晶大岩蛇还得靠我呢。”
小智一行人绕过城镇，到达一条小路旁。小霞问道：“我们要从哪里找起呢？”她茫然地看了看四周，没有任何提示，完全就是大海捞针。小建拿出精灵球说道：“这个时候就要用这个，出来吧，毛球。小智！”小智立马会意，把图鉴翻到大岩蛇的那一页，将图鉴递给小建。
小建将图鉴给毛球看了一下，对它说：“毛球，你去找跟这个一样的东西。”毛球的触角稍微动了一下，然后就带着小智一行人向着一个方向走去，结果只找到了堆石头。小智一见，暗道：果然如此！小霞看着那堆岩石说道：“这个不是啦！这只是一堆普通的岩石而已啦！”小建见毛球活蹦乱跳，有些伤脑筋地对毛球解释道：“毛球，不是的，这个不对了。真伤脑筋啊，回来吧，毛球。”最后直接将毛球收回来了。
小智一行人又回到了一开始的状态。小霞问道：“现在该怎么办啊？”小建再次说道：“只能用别的宝可梦了。”听到这句话，小霞吃惊地道：“小建，你还有别的宝可梦啊？”毕竟小建没有在小智和小霞面前用过。小建点了点头，说道：“嗯，而且还是个法宝呢！”说完，拿出精灵球，放出一只宝可梦。
小霞看到出来的宝可梦，说道：“哇！好可爱啊！”小霞的心立马就被俘获了。小建简单地介绍道：“这是玛力露。”小智补充道：“是水鼠宝可梦，又被人们称为水老鼠，是小霞最爱的水属性宝可梦哦！”小霞一听，更加喜欢了，说道：“真的吗？我也好想要啊！”小建继续介绍玛力露：“不管宝可梦在多远的地方，玛力露都可以用大耳朵听到它的声音。”并且为其感到骄傲。小建拿出录音机调出大岩蛇的叫声给玛力露听：“好了，玛力露，拜托你了！这个是大岩蛇的叫声，帮忙找一下。”然后玛力露的耳朵动了起来，指着一方向叫着，并且向那个方向跑去。小霞见状，对小智和小建说道：“它好像找到了耶！我们跟着走吧！”于是，小智一行人就跟着玛力露走。
一路走来，小智一行人来到了海边。小建听懂了玛力露的叫声，指着对面的小岛说道：“你是说在那座小岛上啊！”小智立刻派出拉普拉斯：“我们走吧，拉普拉斯，就决定是你了！”然后就乘坐着拉普拉斯抵达对岸，小智收回拉普拉斯。继续跟着玛力露走了一段路程，来到一个洞口前，小霞问玛力露：“玛力露，就是这里面吗？”玛力露点了点头。
小智一行人跟着玛力露进入洞中。小霞进洞后，感慨地说道：“好美啊！”洞内有一汪清清的泛着蓝银色的湖水，周围遍布着大块大块的水晶，因阳光折射而发出璀璨的光芒，光芒交织在一起，如同镜面般的湖水也反射着光华，整个洞内如梦似幻，完全无法用语言来形容。小智一行人沉醉于其中，久久不能回神。
过了一会儿，回过神的小智从背包里拿出相机，记录这美丽的时刻，而且刻意将小霞拍下来，小霞看到小智在拍照，随后就让小建帮忙，拍一张和小智一起的合照。
小智收好相机，看着湖面说：“水晶大岩蛇应该就在这湖底了。”小建对玛力露说道：“拜托你了，玛力露，到湖底看看。”玛力露跳进湖中，尾巴上的小球依旧在水面漂浮着，小建解释道：“玛力露的尾巴进入水中就会变成浮桶。”不久，玛力露就跳了上来，水中好像有东西在搅动，平静的水面溅起水花，水晶大岩蛇出现了。
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