上次的战斗中，艾克斯遭受了前所未有的重创，他的身体逐渐消散于虚空之中，为了保护大地，艾克斯直接与大地解除了合体，被强制解除了合体的大地无力地昏迷了，最后被明日奈送回了基地。
医疗室，大地突然惊醒，清醒过来的大地第一时间查看艾克斯终端，看着终端上空空如也的样子，大地一时间难以接受艾克斯离开了自己。
大空大地突然记起了自己昏迷时做的梦，梦中似乎是小时候与父母的记忆，有关于彩虹的故事。
想到这里，大地坚信艾克斯并没有真正消失，他的数据一定还在虚拟世界，必须马上行动起来收集艾克斯的数据。
看到大地清醒过来的格尔曼博士立刻上去探查，大地见到格尔曼博士的瞬间，直接说道：“格尔曼博士，请帮我连接多功能 装置，我要去收集艾克斯的数据。艾克斯现在一定还在虚拟世界！”
“唉？什么，连接？”
思考了两秒，格尔曼博士顿时明白了大地想要做什么，利用多功能装置进入虚拟世界，在那里寻找艾克斯遗留的数据碎片，将艾克斯复活。
两人立刻行动起来，势必要复活艾克斯。
与此同时，地球上的局势也不容乐观。为了追寻两只狂暴化的怪兽——扎拉加斯和迪玛伽，吉奥队员先是找到了迪玛伽沉睡的地方。却在这里遭遇到了亡灵吉娜。
修长的鞭子快速甩来，直击明日奈等人，却被明日奈迅速掏枪击落。
“什么人？”
同行的三月七和星也是拿出了自己的武器警惕的看着出现在她们面前的吉娜。
“这家伙一看就知道不是什么好人。”
“确实，面相太凶了，一点都不友善。”
面对明日奈的询问，吉娜充分发挥了身为反派有问必答的优良传统，直接就说自己是来统治宇宙的。
星看准时机，一棒球棒就敲了上去，吉娜不屑的抬起手臂格挡，棒球棒在接近的瞬间闪烁起蓝色的光芒，吉娜意识到不对想要闪避已经来不及了，直接被星击飞，在空中转了几圈才落地。
“可恶，区区人类。”
“虚拟哥莫拉载入，哥莫拉装甲，合体。”
吉娜刚爬起来，就看见一个人形哥莫拉冲了过来，一双四十厘米长的铁爪直接朝着吉娜拍来，吓得吉娜立刻翻滚后撤。
明日奈见一击未中，继续攻击，但她第一次穿怪兽装甲，显然并不适应哥莫拉装甲，动作总是慢吉娜一步，几招下来都被吉娜灵巧躲过，吉娜一人独战明日奈和星，还能找机会抽明日奈几鞭子。
“明日奈，用这个！”
躲在后边的琉依将虚拟艾雷王的数据传输到了明日奈的XIO终端上。
“虚拟艾雷王载入，艾雷王装甲，合体。”
换上艾雷王这副轻甲，明日奈感觉立刻就上来了，刚刚还被吉娜压着打，现在不需要星帮忙，就已经能压制对方。
眼见自己不是对手，吉娜直接召唤出在地底的扎拉加斯和迪玛伽，自己则是头也不回的离开了。
怪兽出现，吉奥防卫队迅速响应。本就在附近巡逻的隼人和阿渡驾驶着空战马斯凯迪号战斗机，迅速赶来支援。
看到战机出现，扎拉加斯还想故技重施，用强光干扰驾驶员，但吃过一次亏的吉奥早就有了应对的防护措施，隼人和阿渡丝毫没有受到影响。
地面上，星，三月七和明日奈三人一边攻击迪玛伽，将其引到另一边，让琉依等非战斗人员成功撤离。
“那两只怪兽又来了，快，快，快，三月，按照那个外星博士教给你的方法，快召唤艾雷王啊。”
“别催，我正在用。”
三月七支起一片巨大的六相冰，躲在后边手忙脚乱的取出XIO终端召唤虚拟艾雷王。
“虚拟艾雷王载入。”
一只巨大的虚拟怪兽——艾雷王，从虚空中缓缓显现，直接冲向了扎拉加斯和迪玛伽。
艾雷王的加入大大减轻了XIO防卫队的压力。它灵活地在两只怪兽之间穿梭，用连续的电击攻击干扰它们的行动，为隼人和阿渡创造了反击的机会。
另一边明日奈也是获得了哥莫拉的认可，成功召唤出了虚拟哥莫拉。
两只虚拟怪兽和两只凶暴怪兽正面对决，在三月七和明日奈的指挥下，虚拟哥莫拉和虚拟艾雷王的战力稳稳强过扎拉加斯和迪玛伽。
为了防止怪兽再次逃跑，空中的隼人和阿渡用出了格尔曼博士的新装备，直接将战场搬到了独立的亚空间中。
在吉奥面前，两只怪兽隐隐有种被直接超度的趋势。
扎拉加斯&迪玛伽：艾克斯呢？快活过来啊！
此时的虚拟世界，在一片由数据构成的彩虹之下，大空大地找到了一把彩虹之剑。大地握住这把剑的瞬间，一阵柔和而神秘的光芒指引着大地找到了艾克斯的数据碎片，并成功地将它们整合起来。随着一道耀眼的光芒闪过，艾克斯奥特曼重新出现在了现实世界。
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