阿克蒙德和燃烧军团的怒火想要宣泄到背叛他们的兽人身上，然而他们发现，兽人早已在萨尔的率领下，溜到了遥远的卡利姆多。恶魔们向卡利姆多进发，并且在此遇到了一万年前放逐他们的NE（终于又出现了。。。），泰兰德唤醒了德鲁伊，萨尔召集了部落，组成联军共同对抗燃烧军团，与此同时，塞拉摩的人类也加入到了对抗燃烧军团的联军中，并不断有东部王国的增员部队，从塞拉摩登陆集结。半神和守护巨龙，也加入到了战争当中。
阿克蒙德感知到了卡利姆多大路上一股古老而强大的力量----世界之树诺达希尔，只要阿克蒙德吸收了世界树的力量，那么艾泽拉斯将没有任何力量能够对抗阿克蒙德。
插曲：恐惧魔王提康德瑞斯的注意力转向了对卡利姆多的污染，阿尔萨斯等人也逐渐悄悄地开始了自己的计划，诱骗伊利丹杀死提康德瑞斯后，阿尔萨斯趁机回到东部王国，并夺回了洛丹伦的控制权。。。天灾瘟疫已经覆盖人类北方王国全境。。。不断有人逃亡卡利姆多，在吉安娜的帮助下，在沉泥沼泽的塞拉摩得到了庇护。
为避免看不懂，补个插曲中的插曲：伊利丹一万年前因为偷了几瓶儿永恒之井的水，在海加尔山制造了一个微型永恒之井（世界树诺大希尔就是用这汪水种的）事情败露，还杀了几个同胞，被NE囚禁，一关就是一万年，如今燃烧军团再次降临，泰兰德为了增强防御力量，也有点私心，把伊利丹放了出来。
ps：高等精灵则从伊利丹那顺了几瓶儿水，在提瑞斯法北边制造了太阳井。
阿尔萨斯得到巫妖王的指引，带领小部分天灾部队，悄悄来到卡利姆多找到了伊利丹，两者第一次交手不分上下，但阿尔萨斯引诱伊利丹去夺取正在污染费伍德森林的恐惧魔王提康德瑞斯手里的古尔丹之颅，伊利丹顺利杀死了提康德瑞斯（有一个RPG任务），并吞下了古尔丹之路，成为了恶魔的化身，也获取了古尔丹的一部分记忆，包括萨格拉斯之墓的终极力量的秘密。
随着恐惧魔王的死，耐奥祖摆脱了燃烧军团的监视，在卡利姆多搞事的燃烧军团也损失一员大将元气大伤。
……插曲中的插曲完
监视他们的恐惧魔王死后，耐奥祖和阿尔萨斯等人恢复了全部的力量和自由，伊利丹被玛法里奥发现变成了恶魔怪物，被流放。不巧伊利丹半途被基尔加丹逮住了，基尔加丹发现天灾军团和耐奥祖等人已经变得过于强大，而难以控制，于是向伊利丹提出，以燃烧军团高层指挥官职位为奖励，让他去刺杀耐奥祖，消灭天灾军团。
伊利丹同意了基尔加丹的建议，认为完成这样的任务，需要强大的力量。于是伊利丹来到了大漩涡，他召唤了娜迦一族，娜迦一族在瓦斯琪的带领下，认出了伊利丹，并决定和伊利丹结盟。借基尔加丹的命令之便，和娜迦的帮助，伊利丹顺利找到了萨格拉斯之墓，取得了神器萨格拉斯之眼。当他准备运用萨格拉斯之眼的魔力一举摧毁整个诺森德的时候，被不知道有天灾军团存在的玛法里奥和玛维影歌等人发觉，中断了仪式，萨格拉斯之眼也被玛法里奥摧毁。狼狈逃离的伊利丹，决定先去德拉诺避避风头，于是准备带着手下穿过了黑暗之门，半道上遇到了绝望的凯尔萨斯和残余的血精灵一行，瓦斯琪作为前高等精灵，说服凯尔萨斯一起去寻找新的魔力源泉，于是凯尔萨斯率领血精灵加入了伊利丹。人类联盟知道了血精灵的叛变后，将血精灵永远驱逐出了联盟。玛维影歌一路追击，在外域将伊利丹抓获，然而挡不住娜迦和血精灵的进攻，伊利丹又重获自由。
伊利丹的仪式虽然没完成，可也把寒冰王座和世界之脊撕裂了，裂缝中耐奥祖的灵魂逐渐流失。耐奥祖自知时日不多，命令阿尔萨斯赶紧回到寒冰王座传承衣钵，阿尔萨斯自己也感到控制亡灵的力量逐渐衰退。然而此时，由于控制力量减弱，三名恐惧魔王将领（巴纳扎尔，德赛洛克和瓦里玛萨斯）在希尔瓦娜斯的动员下发动叛乱，阿尔萨斯在克尔苏加德的帮助下悄悄跑路。从此被遗忘者诞生，在希尔瓦娜斯的带领下，被遗忘者攻占了洛丹伦原来的部分城市，建立了幽暗城。但被遗忘者，在人类眼里是邪恶的天灾，在天灾眼里是叛徒，在血精灵眼里是腐败的怪物，没有任何人愿意帮助他们（伏笔）。
希尔瓦娜斯和被遗忘者
此刻的伊利丹攒了一波兵，为了完成基尔加丹的任务，再一次带领部队向寒冰王座进发，并在半路遭遇了阿尔萨斯和他的亡灵部队。阿尔萨斯无心恋战，节节溃败，幸好在地穴领主阿努巴拉克的帮助下，通过远古地下通道艰难赶回了寒冰王座，伊利丹却紧随其后，两位大神再次交锋，然而这一次在阿尔萨斯主场，伊利丹因为轻敌失败了（伊利丹变身恶魔飞到天上嘲笑阿尔萨斯不堪一击，上次打成平手之后毫无进步巴拉巴拉，阿尔萨斯见机跳起来一剑，给了伊利丹致命一击，伊利丹战败溜回了德拉诺）。阿尔萨斯穿过冰河，登上冰封王座，耐奥祖命令他戴上自己的头盔，和自己合体（耐奥祖一直期望得到的身体……），阿尔萨斯用符文之剑劈碎了王座，戴上头盔，耐奥祖语重心长的喊出了那句着名的：“现在，我们合体了……（Now，Weareone!）”。（歧义：由于此刻耐奥祖的通灵能力大幅下降，思维不被束缚的阿尔萨斯用符文之剑霜之哀伤劈碎了紧固耐奥祖灵魂的冰块，并将霜之哀伤刺入了耐奥祖的灵魂。）从此耐奥祖作古，全新的，不被燃烧军团支配的巫妖王阿尔萨斯，诞生了。
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