但足协杯因为资金缺乏，导致参赛球队积极性不高，经常出现球队弃权的情况，更让人忧心的是，随着球队的减少，足协杯成了华超和华甲球队之间的垄断游戏，底层球队已经很难打进决赛圈，观赏性和不确定性都大大降低。
而这次改革，一是实行了分区制度，根据地域不同，全国被分成了十六个赛区。基本上每2-3个省就是一个赛区。
例如东北地区就被分成两个赛区。
辽省和吉省一个赛区，黑省和蒙东地区做为另一个赛区。
蒙西地区和甘省，宁省组成一个赛区。
比如疆省因为地域太大，被分成了南疆赛区和北疆赛区。
根据新的组织规则，球队报名不再做任何限制，无论是职业队还是业余队，只要你报名，就可以参加。为了降低门槛，足协甚至连报名费都取消了。
各省市根据自身情况先进行初赛，选出全省前十名的队伍，这样每个赛区将会有20-30支队伍参加。
赛区会根据同省回避的原则进行抽签，抽中的球队会进行主客场淘汰赛，胜者晋级全国赛
全国赛同样如此，根据赛区球队回避的原则进行抽签，进行主客场淘汰赛，直到决出全国32强为止。
在此期间华夏各级联赛的职业队是不参加的，但青年队可以参加。
然后，全国32强的队伍将同华亿，华冠和华丙的队伍混合抽签，主客场淘汰赛，一直到决出新的全国32强为止。
为了保护参赛球队的利益，凡是晋级到省前十名的，足协会一次性给予80万元的参赛费。
此后，每增加一场比赛，足协会给予球队10万元的参赛费。
这意味着，只要该球队进入全省前十名，保底收入也有100万元，这还不算各级赞助费和比赛直播分红等。
同样，各级联赛的职业球队参加足协杯也有高额的参赛费可拿。
华亿球队参加一场足协杯可得34.5万元的参赛费，华冠球队是25.5万元参赛费，华丙球队是17.5万。
此外针对低级别球队还特别设立赢球奖。
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