隶属于科学特别搜查队（简称：科特队）的早田进队员，在驾驶飞机巡逻时，发现一个红色球体正在追逐着蓝色球体，红色球体无意中撞上早田的飞机，早田因此牺牲。本已牺牲的早田被吸进红色球体内，遇到了来自M78星云的奥特曼，并得知其为追击宇宙怪兽百慕拉而来至地球。奥特曼为补偿早田遂决定与其合为一体，并将自身生命赋予早田。于是，两者便开始协同科学特搜队与怪兽及宇宙人展开了激烈的地球保卫大战。
科学特搜队的早田进队员在驾驶巡逻机工作时，突然发现一个红色球体正追逐着蓝色球体。红色球体无意中撞上早田进的飞机，早田由此牺牲。随后，早田进被吸入到红色球体内，遇到了来自M78星云的宇宙英雄·奥特曼。并得知其为追击宇宙怪兽·百慕拉而来到地球。奥特曼为补偿早田遂决定与其合体与百慕拉一战，并将自己的生命赋予了早田。
最终，科学特搜队用S16潜水艇攻击使百慕拉浮出水面，早田变身为奥特曼后与百慕拉展开肉搏战，最终大获全胜
20亿3000万巴尔坦星人在宇宙间旅行时，飞船的重力平衡出了问题，于是来到地球修理，因为地球有其修理重力平衡所需要的晶体二极管。但来到地球的巴尔坦星人被地球迷住，巴尔坦星人企图对地球展开侵略。不过最终，巴尔坦星人的野心还是被奥特曼所粉碎。远古时期潜藏于城市地底的怪兽·内隆嘎苏醒，其靠吸食电源为生，平时身体呈透明状态，一吸电就现形，并袭击发电站以获取更多电力。能从头部的角和两边的触角交错发射高压电攻击对方，先被星野勇用激光枪打瞎了左眼，再被奥特曼摔死，最后被斯派修姆光线所击杀。
凶悍的海底原人，遭受原子弹的辐射后身体变的十分巨大，其身上挂着开发木星的火箭爆炸后所遗失的最后一颗原子弹，喜欢听音乐，口喷白色光线。格斗与奥特曼互角，最后被斯派修姆光线击毙。
男记者小林在回家的路上发生车祸身亡，但奇怪的是其身亡的原因其实是窒息，在现场调查的科学特搜队的村松与早田发现在小林的汽车旁边与车窗上都有种奇怪的绿色粘液，初步调查的知小林曾经参与到奥伊利斯岛的考察队，但很快发现考察队的成员都陆续遇害，只有女摄影师没有事。于是科特队马上找到了她，女摄影师回忆她自己在岛上就曾经遭到该植物袭击，而植物后来被山田博士拿回做植物改良；而那个植物在杀害山田后就已经不见。岩本博士提出，应是放射能让这个植物发生了变化，植物果然来袭击女摄影师，但是被击退，岩本对却科特队泼了冷水，如果这植物没有消灭掉，而吸收攻击时的放射能那又会如何？坏消息来了，巨大化的绿蒙斯冲进了城市，岚先展开攻击，但马上中了毒雾，早田马上变身，即使是奥特曼仍然挡不住绿蒙斯的毒，能量快耗尽时，奥特曼发出斯派修姆光线直接杀死绿蒙斯。
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