曾国藩以扞卫孔孟之道为口号，向士兵灌输儒家的忠君爱国、仁义道德等思想，培养士兵的忠诚意识和战斗意志。这种思想教育，使得湘军士兵在战斗中具有较强的精神动力，能够不畏强敌、奋勇作战。
通过宣传太平天国运动对传统文化和封建秩序的破坏，激发士兵的仇恨心理和战斗热情，让士兵们认识到自己是在为保卫家乡、保卫国家而战。湘军到太平天国运动后期人数达到 30 万左右。
曾国藩组建的湘军在与太平军的多次战斗中逐渐占据上风，攻克了安庆、九江等重要城市，对天京形成了包围之势。
除了湘军之外，清政府还组织了其他地方武装，如淮军等，这些武装力量也在一定程度上配合了湘军的作战，对太平天国形成了包围和打击。
外国势力在太平天国后期逐渐倾向于支持清政府，向清政府提供了军事援助，包括武器装备、军事顾问等。例如，洋枪队的组建就是外国势力支持清政府镇压太平天国的体现，洋枪队在一些战斗中给太平军造成了很大的损失。
外国势力对太平天国进行了经济封锁，限制了太平天国与外界的贸易往来，使得太平天国的经济状况更加困难，无法获取必要的物资和资金支持。
1864年，洪秀全病逝，幼子洪天贵福继位。湘军成功攻陷天京。在天京被攻破后，李秀成和幼天王试图突围，但相继被害，至此太平天国运动在主要地区失败。
天京陷落后，太平军余部并没有立刻停止抗争。他们在赣、闽、粤边界地区继续坚持战斗，不过到了 1866 年春，这些余部被扑灭。还有一部分太平军与捻军相结合，在中原地区继续奋战，但最终在 1868 年春也被清军歼灭。将太平天国运动彻底镇压下去。
太平天国与清政府进行了长达十几年的激烈战争，双方在战场上投入了大量兵力，战争中人员伤亡惨重。导致了无数士兵和平民的死亡。
太平天国运动期间，各地战乱频繁，社会秩序陷入混乱。土匪、强盗横行，百姓生命财产安全得不到保障。同时，农业生产遭到严重破坏，粮食短缺引发饥荒，进一步加剧了人员的死亡。
再者，清政府的残酷镇压也是重要因素。清政府为了维护统治，对太平天国进行了全力围剿。在镇压过程中，清军往往采取极端手段，对太平军及支持太平天国的地区进行大规模屠杀和破坏。
外国列强的干涉也加重了灾难。列强的军事介入带来了更先进的武器和更残酷的战争手段，导致更多的人员伤亡。
洪秀全创立的拜上帝教并非纯粹的反清组织。洪秀全自称是上帝次子、耶稣之弟，借助宗教神话来树立权威、凝聚人心。这种迷信的方式在一定程度上影响了起义的性质和走向，使得太平天国运动在后期出现了许多不理性的决策和行为。
过度的迷信也使得太平天国在一些重大决策中往往依赖所谓的“上帝启示”，容易引发内部的矛盾和分裂，一些将领和民众对宗教教义的理解不同，导致了内部的纷争和混乱。
太平天国运动是人类历史上死伤极其惨重的战争之一。这场运动对中国的社会经济、人口结构、文化传承等方面都造成了极其深远的破坏和影响。学者们估算。中国人口从太平天国运动前的4.3亿减少到运动后的3.5亿，相当于减少了8000万人。还有人认为死亡人数可能高达1.2亿或1.6亿。
太平天国运动加速了封建制度的崩溃。它提出的一些思想和主张，如《天朝田亩制度》中对土地分配的设想，对后来的革命运动产生了一定的启示。促使中国的一些有识之士开始反思中国的现状，推动了中国近代化的进程。
清朝中叶以后，改河运为海运，使得黄淮两岸大批船夫、水手、运输工人失业，沿河城镇的工商业也萧条衰落，中小商人、手工业者相继破产，加之自然灾害频频发生，百姓面临着土地被兼并的困境，大量农民失去土地沦为流民，于是北方发起一次大规模捻军起义
1852 年，张乐行、龚得树等在皖北雉河集一带起义，捻军 5 万余人歼灭清军和地主武装，形成十余支相对独立的队伍，势力迅速发展至十余万人。
1857 年，捻军接受太平天国领导，配合太平军将领陈玉成、李秀成在河南、安徽等地与清军作战。但因鄂东战役失利，捻军分裂为淮南捻军与淮北捻军。淮南捻军继续配合太平军作战，逐渐转衰。最终被僧格林沁带领的清军围歼剿灭。
太平天国运动和捻军起义从爆发到被镇压前后持续了十五年左右时间，消耗了清朝大量人力、财力与物力，动摇了清朝的统治地位。使得国家财政陷入困境，社会秩序遭到严重破坏。
这场起义并非毫无意义。为后来的改革提供了一定的启示和基础。起义揭示了清朝统治的腐朽与社会矛盾的尖锐，让人们深刻认识到旧制度的弊端。它促使一些有识之士开始反思国家的现状，寻求变革之路。在起义的冲击下，清朝的统治根基被动摇，为后来的一系列改革和革命埋下了伏笔。
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