既然已经在皇上那承诺了整顿羽林府军两卫，贾瑀等到石磊、徐宁以及诸位军官到来后，便马不停蹄地开始了整顿工作。
首先是羽林卫，整顿起来相对轻松些。随着孟辉祖和李大安被调走，现在两个副手指挥同知分别是谢鲸和赵信。谢鲸是开国一派，自从贾瑀上任以来，他对贾瑀的工作十分配合。虽然不知他出于什么目的，但贾瑀也乐见其成。至于赵信，这是皇帝亲点的，贾瑀心知定是皇帝的亲信。暂时来看，赵信也会配合自己工作。
所以这时，贾瑀把石磊安置在羽林卫担任镇抚使。石磊为人沉稳，足智多谋，在军中素有威名。贾瑀相信，有他在羽林卫，定能稳住局面。然后又把从军中调来的军官安排了 五人人在羽林卫中。这五人人皆是贾瑀精心挑选的得力干将，根据他们的品级分别担任千户、百户等职。
安排妥当后，贾瑀又对谢鲸和赵信的工作进行了分工。他让两人轮流负责，一人负责巡警事务，维护京城的治安；另一人则负责训练士兵，提升羽林卫的战斗力。
安顿好羽林卫后，接下来就是府军卫。府军卫的情况则相对麻烦得多，单单只是指挥使就有 五人人，这五人人分属不同派系，让贾瑀颇为头疼。
孟辉祖和李大安刚刚从羽林卫升任过来，对于府军卫来说，这两人就是贾瑀带来的亲信，但是他们到底会怎么样，贾瑀还需要时间去揣摩。另外一名指挥使名唤张靖宇，此人乃是从边军调入，现今不清楚是谁的人。贾瑀决定先暗中观察他的一举一动，再做打算。还有一名指挥使叫做钟大川，这是太上皇以前的侍卫。对于他，贾瑀深知不能轻易得罪，需谨慎应对。最后一名指挥使名叫庞春，乃洪熙一派武城侯庞阳之弟。庞春此人，仗着兄长的权势，平日里颇为嚣张跋扈。
这下面还有指挥同知十人，指挥佥事二十人，镇抚使十人，千户副千户几十。
贾瑀坐在府军卫的营帐中，面色凝重地看着手中的名单，心中思绪万千。他深知，要整顿好府军卫，必须先理清这些人的关系，找到突破口。
这一日，贾瑀带着徐宁，身后跟着从边军中选调来的 15 名军官以及亲兵，浩浩荡荡地来到府军卫。只见贾瑀神色肃穆，目光坚定，一身戎装更显威严。
到达府军卫后，贾瑀毫不犹豫地命人擂鼓聚将。沉重的鼓声在军营中响起，仿佛要震破苍穹。只见鼓响以后，军营四处陆陆续续有将官走来。他们有的神色匆匆，有的则满不在乎，交头接耳。
贾瑀在大厅中稳坐，目光如炬，看着一个一个进入的将官，心中默默思量。他的眼神犀利，仿佛能看穿每一个人的心思。同时，他照着名录不时询问身旁的一名经历，对进来的将官一一核对。
三通鼓停，整个军营顿时安静下来，气氛紧张得让人窒息。贾瑀吩咐徐宁唱名。徐宁声音洪亮，中气十足，将一个个将官的名字喊出。
唱名结束，贾瑀的脸色愈发阴沉。他发现有指挥使庞春一人，指挥同知三人，佥事七人，镇抚使两人，千户四人，副千户一人未到。这时，贾瑀目光凌厉地问道：“按照名录上未到之人是何原因？有无请假。”
经历看看四周，无人回答，他自己也吓得浑身颤抖，磕磕绊绊答道：“回大人，无人请假，无人登记请假。”
贾瑀猛地一拍桌子，站起身来，大声说道：“军法，三通鼓聚将，不到者斩。这些人既然未请假，又无故不到，是何原因？”他的声音在大厅中回荡，震得众人耳朵嗡嗡作响。
贾瑀怒目圆睁，接着说道：“镇抚使赵光辉、苗发，点起一千兵马，给我将这些人拿来！”
赵光辉和苗发齐声应道：“是！”随即转身，迅速点兵去了。
大厅中的将官们此刻都噤若寒蝉，大气都不敢出。他们深知贾瑀此番是动了真格，心中都暗自揣测着自己的命运。
贾瑀在大厅中来回踱步，脸色铁青。他心中明白，这些未到之人是在故意给他下马威，想要试探他的底线。但他贾瑀岂会轻易退缩？今日若不立威，往后这府军卫的整顿工作将更加难以进行。
过了大约一个时辰，赵光辉和苗发带着兵马回来了，那些未到的将官也被五花大绑地押了过来。
贾瑀看着这些人，冷冷地说道：“你们可知罪？”
其中一个指挥同知梗着脖子说道：“大人，我们不过是有事耽搁了，何必如此大动干戈？”
贾瑀怒喝道：“有事耽搁？军法如山，岂容你等狡辩！来人，将他们推出去，斩！”
亲兵们一拥而上，就要将这些人拖出去。这时，其他将官看贾瑀动了真格，这其中有很多是自己下属亲朋故旧，也不再旁观纷纷跪地求情：“大人饶命，饶命啊！”
贾瑀沉默片刻，知道自己不可能真的杀了他们，说道：“看在众人求情的份上，暂且饶你们不死。但治军必严，今日之事本帅会上报皇上！”
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