卧底警员在庶务部工作期间，内部调查科会根据卧底提供的行动报告，以及其直属上司的评价进行调查，主要是确认警员卧底期间没被犯罪组织策反，以及在卧底期间没有严重违法行为。
调查结束后，内部调查科会对被调查的卧底警员出一份《道德评估报告》给到人事科，这《道德评估报告》分优秀、良好、达标、恶劣四个等级，人事科根据该报告的评级，重新调整卧底警员的职务。
人事科会对优秀和良好两级的卧底警员升职加薪，并且可自己挑选想去的部门，这两个评估级别的卧底警员都会选择回原来的部门，毕竟卧底成功归来且升职加薪的警员，回原部门肯定会受到重用。
《道德评估报告》评估为达标的卧底警员，一般都是在卧底期间有重大过失，但最终完成了任务，警队综合各种因素考虑，出于对卧底警员的补偿性质，继续聘任其担任警察，会升职加薪，但会调离一线部门，去交通组、巡查队、甚至是去守水库。
周星星和曹达华两人就是卧底其间有重大过失，《道德评估报告》被评级为达标，才从之前的飞虎队和重案组被调去交通组和军装组。
一旦卧底警员其《道德评估报告》评估为恶劣，就意味着该警员在卧底期间，有超出律政司对卧底警员刑事豁免范围的严重违法行为。此时，内部调查会启动对该卧底警员在卧底期间的刑事调查，待查明事实后，上交宪委管理层开会决定，是否对该警员提起刑事指控。
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