就在旅行者即将战胜黑袍人的时候，黑袍人突然引爆了周围的黑暗岩元素水晶，引发了一场剧烈的爆炸。旅行者和派蒙被爆炸的冲击力震飞出去，重重地摔在地上。当他们挣扎着起身时，黑袍人已经消失不见，只留下一个散发着黑暗气息的巨大阵法在层岩巨渊的核心处缓缓运转。
旅行者意识到这个阵法的危险，他仔细观察阵法的结构，发现这个阵法是由复杂的岩元素符文和黑暗力量链条交织而成。如果不尽快破坏它，璃月的岩元素核心将会被彻底侵蚀，整个璃月都将陷入黑暗与混乱。
旅行者开始尝试破解阵法，他运用在各个国度冒险所积累的元素知识，小心翼翼地触碰着阵法上的符文。每一次触碰都伴随着一阵强烈的元素反噬，但旅行者咬紧牙关坚持着。派蒙在一旁焦急地为旅行者加油打气，同时也警惕着周围可能出现的危险。
与此同时，璃月七星和钟离也没有坐视不管。凝光从群玉阁上调动各种机关器械，朝着层岩巨渊赶来。这些机关器械能够发射出净化的岩元素力量，可以对神秘组织的黑暗力量起到一定的克制作用。刻晴则带领着千岩军中的精锐部队，深入层岩巨渊，为旅行者提供支援。钟离也亲自前往，他以古老的岩元素神力，暂时稳定住层岩巨渊即将崩塌的地层结构。
随着旅行者逐渐摸清阵法的规律，他开始发动猛烈的攻击。他将风元素注入剑中，利用风元素的切割之力斩断黑暗链条，然后用雷元素引发符文之间的冲突，使其出现破绽。在千岩军和璃月七星等人的协助下，阵法的力量被一点点削弱。
然而，神秘组织不会轻易放弃。就在阵法即将被破坏的时候，他们从黑暗中召唤出了一只被完全黑化的若陀龙王。这只若陀龙王双眼燃烧着黑暗火焰，它的每一次攻击都带着毁天灭地的力量。旅行者和千岩军们陷入了一场艰苦卓绝的战斗。
旅行者明白，若陀龙王虽然被黑暗控制，但它的核心仍然是璃月的古老岩元素生物。他尝试着唤醒若陀龙王内心深处的记忆，在战斗的间隙，旅行者用岩元素之力与若陀龙王建立起一种特殊的联系，向它传递着璃月的景象、璃月人民的契约精神以及它曾经守护璃月的使命。
在旅行者的努力下，若陀龙王的攻击逐渐有了一丝犹豫。就在这时，钟离施展神力，发出一道净化之光，穿透了若陀龙王身上的黑暗外壳。
在钟离施展神力，发出一道净化之光穿透若陀龙王身上的黑暗外壳后，若陀龙王发出一声震天动地的怒吼。那吼声中既有解脱黑暗束缚的畅快，也有对神秘组织的愤怒。它巨大的身躯开始颤抖，身上的黑暗气息如潮水般褪去，岩元素原本的力量重新在它身上流转。
若陀龙王恢复理智后，没有再对旅行者等人发动攻击。它似乎明白了当前的局势，转头看向那还在运转的黑暗阵法，眼中闪过一丝决然。它庞大的身躯猛地冲向阵法，以自己的力量去冲击那邪恶的源泉。
旅行者和千岩军们也没有闲着，趁着若陀龙王制造出的混乱，旅行者再次冲向阵法。他将自己全身的元素之力汇聚于剑上，与派蒙合力发出一道超强的元素冲击。这股力量与若陀龙王的攻击一同击中了阵法，伴随着一阵耀眼的光芒和震耳欲聋的爆炸声，黑暗阵法终于被彻底摧毁。
但神秘组织的阴谋再次受挫，并不意味着他们就此罢休。在璃月的这场交锋让他们变得更加谨慎和狡猾。他们开始在暗中重新集结力量，并且将目光投向了稻妻。
稻妻，那个充满雷元素力量的岛国，正被锁国令笼罩着，其内部局势本就复杂。神秘组织认为这是一个绝佳的机会，他们悄悄潜入稻妻，开始在各个岛屿上散播混乱的种子。
在稻妻的鸣神岛，原本平静的稻妻城开始出现一些离奇的事件。居民们发现城中的雷樱树时不时地闪烁出诡异的黑色电弧，而奉行所接到的报案也日益增多，有民众称看到一些似人非人的黑影在夜间穿梭于大街小巷，还有些武士莫名失去了对元素力的控制，手中的武器不受控制地释放出紊乱的雷元素力量。
旅行者和派蒙听闻稻妻的异样后，决定即刻前往。当他们乘坐船只抵达稻妻的码头时，感受到了一股压抑的氛围。负责守卫的天领奉行武士们表情严肃，对进出的人员进行着严格的盘查。
旅行者在稻妻城中四处探寻，发现这里的雷元素力似乎被一种无形的力量干扰着。他来到稻妻大社，希望能从八重神子那里得到一些线索。八重神子站在神社前，她那粉色的耳朵微微晃动，似乎已经察觉到了神秘组织的存在。她告诉旅行者，稻妻的雷元素核心与鸣神岛深处的地脉以及天空岛上的力量有着微妙的联系，神秘组织如果想要掌控稻妻的雷元素力量，必然会对这些地方下手。
就在旅行者和八重神子交谈之际，稻妻城突然传来一阵骚乱。他们赶到城中，发现一群被黑暗力量侵蚀的武士正在街道上横冲直撞，这些武士的眼睛闪烁着诡异的红光，手中的武器散发着浓烈的黑暗雷元素气息。
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