虽然曲阜城的清军抵抗依然顽强，不断的涌出防守士兵站在城头，但是城墙和城门却扛不住了，终于在爆破组的努力下，将曲阜东门炸开，金州军进入城中与守军展开厮杀。
曲阜城内的清军不足万人，孔有德属于绝对优势兵力，终于在天黑之前肃清了城内的清军，大部分被金州军歼灭，少部分逃向兖州方向。
但是孔有德很快就发现出了大事儿，城内孔家核心人物一个也不见了， 通过审问俘虏得知，早在半个月前，清廷派了一个姓李的大官过来拜见孔家家主，双方聊了几天后，孔家重要人物都跟着李姓官员去济南了，留下的孔家人一无所知。关键这么重要的信息，却没有得到任何方面的传报。
但是事已至此，拿捏孔家的方案暂时宣告失败，大军的既定目标还是不能变，必须拿下兖州，济宁，牢牢扼守住运河一线！
相比曲阜城来说，兖州更难打，兖州城不光城高坚固，地势更为平坦，清军还是一样的套路，城上坚守，城外挖战壕拒敌。
清军的主动攻击欲望不强，这让孔有德心生怪异，清军这不是学习金州军以往的作战方法了，不对攻，只防守。仅仅三天的时间，金州的其它装备给养还过得去，但是火炮炮弹不管是实心弹还是开花弹，携带的弹药数量只剩下三分之一，这样下去就算攻下了兖州城，也扛不到济宁，后续的弹药补给迟迟未到，好在泰安方向，清军没有派出援军。
因为李英杰的骑兵此时也用不到派场，孔有德干脆派李英杰回去胶州协助运送弹药去了。
李英杰率骑兵马不停蹄向胶州方向而去，很快他就发现问题了，从胶州过来的补给线受了沂州的清军围追堵截，损失严重已经退回了胶州。
但是前线十万火急，李英杰火速回胶州，在文松的筹备下，新的补给队伍又出发了，这次在李英杰的强有力护送下，补给勉强顺利的通过沂州，而且沂州方向的清军只以骚扰为主并不真正攻击，仿佛只是为了延缓金州军的节奏。
等李英杰带着补给赶回了兖州，此时兖州已经被孔有德拿下，但是金州军也付出了巨大的伤亡。兖州的城外防御部分清军依然是且战且退，但是兖州城的清军利用一切的防守力量，死战不退，只是在金州军的火炮和燧发枪的强势攻击下，死伤十分严重，金州军在付出了近二千的伤亡下终于登上了城头，城内的一万多的清军大部分被歼灭，少部分投降，逃走的非常少。这让孔有德觉得诡异，这些清军不都是汉人吗？有必须这么拼吗，他可是大明封的正牌山东巡抚，难道还没有丁文盛好使吗？
下一步，济宁！
此时济宁城清军竟然又集结了二万多人，主要是从曹州方面调过来，已经在运河两岸做好了防守。
“殷廷辂怎么还不回来？我们都到济宁了，也没有水师方面的消息，就靠我们在地上死拼！”孔有德有些怨气的对着手下将领发脾气，这在一众将领这里平时可是不多见的，孔有德一向很稳，天塌了都不急的人怎么现在成这个样子，其实大家心里也清楚，这行军事行动不太顺利，跟以往金州军的任何行动相比都是显得极为被动。
“孔大人，我知道，殷统领在处理特战队执行第二方案的时候，好像也不太顺，一直在临淄！”李英杰道。
“唉，还是按照计划进行吧，马上就十一月份中旬了，我们马上就杀到济宁城下了。除去路上城池的防守人员，我军目前只剩下八千能战人员，而且一半以上还是骑兵，好在英杰带来的大量弹药补给，我们还是可以发挥火器优势，我们要注意人员伤亡，不能再扩大了！”
济宁在运河的东侧，此时清军仍然是保持了城内外的防守姿态，但是这一次运河西侧的策应也给金州军带来一定的麻烦，相当于说同时要面对三个方向的威胁。
双方就这样对峙了两天，孔有德实在等不下去了，水师迟迟不到，长期对峙下去对于金州军军心不稳定。于是命李英杰监视北面的清军动态，其余全部投入对济宁的攻击上来。
孔有德孤注一掷，将六十门重炮对济宁城进行了全方位火力覆盖，小炮和燧发枪火力对着前沿阵地的清军也是无差别的攻击，运河西岸的清军火炮也对金州军进行远程攻击，虽然没有什么效果，但是也多多少少有些威胁。济宁城上和城外的清军虽然也有炮火，但是整体上还是被压制的。仅仅一天多的时间，孔有德就消耗了一半的弹药，尽管对敌方的杀伤效果是十分有效的，可是这样下去真的是让孔有德心中惴惴不安。
就在第二天战斗的傍晚时分，只见运河上快速驶来十多艘剪刀船，一到就加入战场，对清军展开了自由攻击，炮击和燧发枪攻击瞬时进入了疯狂模式。
孔有德阴沉的脸色终于有了好转，但是天色己晚，金州军已经打了一天，再打下今晚也拿不下济宁城，济宁城的防守依然很顽强，于是孔有德下达了停止作战命令。
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