神龙元年（乙巳，公元705年）
二月辛亥日，中宗率领文武百官前往上阳宫问候太后的起居；从此以后，每十天去一次。
甲寅日，恢复国号为唐。郊外祭祀、宗庙祭祀、社稷祭祀、帝王陵寝、百官设置、旗帜样式、官服颜色、文字规范，都恢复到永淳元年以前的旧制。又将神都改回东都，北都仍为并州，尊奉老君为玄元皇帝。
乙卯日，凤阁侍郎、同平章事韦承庆被贬为高要尉；正谏大夫、同平章事房融被削除官籍，流放到高州；司礼卿崔神庆流放到钦州。任命杨再思为户部尚书、同中书门下三品、西京留守。
太后迁居上阳宫时，只有太仆卿、同中书门下三品姚元之痛哭流涕。桓彦范、张柬之对他说：“今天难道是您哭泣的时候吗！恐怕您的灾祸会从此开始。”姚元之说：“我侍奉则天皇帝很久了，突然这样分别，悲痛之情难以抑制。况且我前些天跟随各位诛杀奸逆，是臣子的道义；今天送别旧君，也是臣子的道义，即使因此获罪，我也心甘情愿。”当天，姚元之被外放为亳州刺史。
甲子日，册立妃子韦氏为皇后，大赦天下。追赠皇后的父亲韦玄贞为上洛王、母亲崔氏为王妃。左拾遗贾虚己上奏疏，认为：“异姓之人不能封王，这是古今通用的制度。如今正是国家中兴的开端，天下百姓都翘首以盼陛下的新政；而陛下先封皇后的亲族为王，这不是向天下人彰显美德的做法。况且前朝追赠皇后的父亲为太原王，这个教训并不遥远，必须防范由此引发的后患。如果已经颁发了恩宠的制书，应当让皇后坚决推辞，这样更能增添她谦逊的美德。”中宗没有听从。
起初，韦后生下邵王李重润、长宁公主和安乐公主，中宗被流放房陵时，安乐公主出生在途中，中宗特别疼爱她。中宗在房陵与韦后一同被幽禁，历经艰难危险，夫妻感情十分深厚。中宗每次听到朝廷使者到来，就惶恐得想要自杀，韦后制止他说：“祸福没有定数，宁愿等待死亡，何必这么急切呢！”中宗曾经私下对韦后发誓：“将来有幸重见天日，一定任凭你随心所欲，不加任何限制。”等到韦后再次成为皇后，便开始干预朝政，就像武则天在高宗时期那样。桓彦范上奏表，认为：“《易经》说‘妇人不要擅自做主，只需负责家中饮食事务，就能保持贞洁吉祥’，《尚书》说‘母鸡在早晨打鸣，这个家庭就会衰败’，我看到陛下每次临朝听政，皇后必定隔着帷幔坐在殿上，参与听闻政事。我私下观察自古以来的帝王，没有哪个与妇人共同执政而不导致国家灭亡、自身受害的。况且以阴凌驾于阳之上，是违背天意的；以妇人欺凌丈夫，是违背人情的。希望陛下借鉴古今的教训，以国家和百姓为重，让皇后专门居住在中宫，管理后宫事务，不要到外朝干预国家政事。”
在此之前，胡僧慧范凭借虚假荒诞的法术游走于权贵之门，与张易之兄弟关系密切，韦后也很器重他。等到张易之被诛杀，慧范又声称自己参与了诛杀张易之的谋划，凭借功劳被加封为银青光禄大夫，赐予上庸县公爵位，能够自由出入皇宫，中宗还多次微服前往他的住所。桓彦范再次上奏表说慧范使用旁门左道扰乱朝政，请求诛杀他。中宗都没有听从。
起初，武则天诛杀唐朝宗室，有才能德行的人先被处死，只有吴王李恪的儿子郁林侯李千里性情偏激浮躁，没有才能，又多次进献祥瑞之物，所以唯独得以幸免。中宗即位后，将他立为成王，任命为左金吾大将军。武则天所诛杀的唐朝诸王、王妃、公主、驸马等人，都没有人安葬，他们的子孙有的流窜到岭南，有的被囚禁多年，有的逃匿在民间，成为别人的雇工。到这时，中宗下制书命令州县寻找他们的灵柩，按照礼仪改葬，追复他们的官爵，召回他们的子孙，让他们承袭官爵，没有子孙的就为他们选择后人继承。不久，宗室子孙相继前来，中宗都召见了他们，这些人痛哭流涕、叩拜舞蹈，中宗根据他们与皇室的亲疏关系，分别授予不同的爵位和官职。
诛杀张易之、张昌宗时，洛州长史薛季昶对张柬之、敬晖说：“两个奸凶虽然被除掉了，但武氏子弟就像汉朝的吕产、吕禄一样仍然存在，除草不除根，终究会再次生长。”张柬之、敬晖二人说：“大事已经平定，他们就像砧板上的肉罢了，能有什么作为！诛杀的人已经够多了，不能再增加了。”薛季昶叹息说：“我不知道会死在哪里了！”朝邑尉武强人刘幽求也对桓彦范、敬晖说：“武三思还活着，你们这些人终究会没有葬身之地；如果不早点图谋除掉他，将来后悔就来不及了。”桓彦范、敬晖没有听从。
中宗的女儿安乐公主嫁给了武三思的儿子武崇训。上官婉儿是上官仪的孙女，上官仪被杀后，她被没入后宫为奴，她聪慧善辩，擅长写文章，熟悉官府事务。武则天很宠爱她，从圣历年间以后，百官的表章奏疏大多让她参与决断；等到中宗即位，又让她专门负责起草皇帝的制命，更加信任重用她，任命她为婕妤，在宫中掌权。上官婉儿与武三思私通，所以依附武氏集团，又把武三思推荐给韦后，将他引入宫中，中宗于是与武三思商议国家政事，张柬之等人都受到武三思的牵制。中宗让韦后与武三思一起玩双陆棋，自己则坐在旁边为他们点数筹码；武三思于是与韦后私通，从此武氏集团的势力再次振兴。
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