刘秀得知消息后，心里十分着急，他知道刘玄迟早会对自己下手，必须尽快调动幽州的兵马，扩充自己的实力，可苗曾手握重兵，又有刘玄的命令，肯定不会轻易交出兵权。
这时候，刘秀想到了吴汉，他觉得吴汉办事果断，勇猛过人，是去幽州调兵的最佳人选。
刘秀召见吴汉，把自己的想法跟他一说。
吴汉二话不说，当即领命，带着几个随从就往幽州赶，刘秀身边的将领都劝他，说苗曾阴险狡诈，吴汉只带几个人去，太危险了，不如多带点兵马，可刘秀却摇了摇头，说吴汉办事，我放心。
事实证明，刘秀的眼光确实毒辣，吴汉到了幽州之后，苗曾果然表面上热情接待，暗地里却调兵遣将，准备在酒席上拿下吴汉，吴汉早就看出了苗曾的心思，他不动声色，陪着苗曾喝酒，趁着苗曾放松警惕的时候，突然拔出腰间的长刀，一刀就结果了苗曾的性命。
苗曾一死，幽州的军队群龙无首，吴汉提着苗曾的首级，登上高台，对着幽州的将士们大喊：“苗曾勾结刘玄，意图谋害刘公，今我已斩之，愿随我投奔刘公者，封侯拜相，不愿者，悉听尊便！”
幽州的将士们早就听说过吴汉的威名，又佩服他的胆识，加上刘秀在河北深得人心，当即纷纷表示愿意追随吴汉，吴汉就这样兵不血刃，拿下了幽州的十万兵马，然后带着这些兵马，浩浩荡荡地回到了刘秀身边。
刘秀见到吴汉带着十万大军回来，又惊又喜，对吴汉更加信任，可他万万没想到，吴汉这股狠劲，不仅对敌人管用，有时候对自己人也同样狠，甚至差点酿成大祸。
公元26年，刘秀称帝之后，派吴汉率领大军征讨南阳的邓奉，邓奉原本也是刘秀的部下，后来因为吴汉的部下在南阳烧杀抢掠，残害百姓，邓奉一怒之下起兵反叛，刘秀无奈，只能派吴汉前去平叛。
吴汉接到命令后，带着大军就出发了，他打仗确实厉害，很快就把邓奉的军队打得节节败退，可他手下的士兵，却依旧改不了烧杀抢掠的毛病，所到之处，百姓流离失所，怨声载道，吴汉对此不管不顾，他觉得打仗嘛，难免会有伤亡，抢点东西也是正常的。
可他没想到，正是他的纵容，让邓奉的军队得到了百姓的支持，邓奉借着百姓的怨气，重新集结兵力，居然反过来把吴汉的军队打得大败。
吴汉带着残兵败将狼狈逃窜，差点全军覆没，消息传到洛阳，刘秀气得差点吐血，他没想到吴汉居然这么鲁莽，不仅没平定叛乱，还把事情搞得这么糟。
刘秀无奈，只能亲自率军出征，才平定了邓奉的叛乱，回到洛阳之后，刘秀把吴汉叫来，狠狠训斥了一顿，吴汉这才意识到自己的错误，跪在地上连连请罪。
刘秀看着吴汉满身的伤痕，想到他多年来南征北战的功劳，终究是不忍心严惩，只是罚了他半年的俸禄，让他以后务必约束部下，不得再残害百姓。
经此一事，吴汉收敛了不少。
他知道刘秀虽然宽厚，但也不是没有底线，从那以后，他不仅严格约束自己的部下，还开始学着体恤百姓，打仗的时候，尽量不骚扰百姓，所到之处，秋毫无犯，百姓们对他的印象也渐渐好了起来。
如果说邓奉之乱是吴汉人生中的一个污点，那接下来的几场战役，就是他封神的时刻，尤其是征讨公孙述的战役，更是把他的军事才能展现得淋漓尽致。
公孙述是当时盘踞在蜀地的军阀，占据益州之地，地势险要，兵精粮足，自称为帝，与刘秀分庭抗礼，刘秀先后派了好几路大军征讨公孙述，都无功而返，甚至损兵折将，最后，刘秀还是想到了吴汉，把征讨公孙述的重任交给了他。
公元35年，吴汉率领三万大军，沿着长江逆流而上，进攻蜀地，公孙述得知吴汉前来，不敢大意，派了手下最精锐的军队，在夷陵一带布下重兵，想要凭借长江天险，挡住吴汉的大军。
吴汉到达夷陵之后，看着滔滔江水和对岸严阵以待的敌军，并没有急于进攻，他知道蜀地地势险要，强攻必然损失惨重，他先是派人暗中勘察地形，摸清了敌军的布防情况，然后决定兵分两路，一路大军假装正面进攻，吸引敌军的注意力，另一路大军则趁着夜色，悄悄绕到敌军后方，发动突袭。
夜色深沉，江水滔滔，吴汉亲自率领精锐部队，乘着小船，悄悄渡过长江，摸到了敌军的后方，当敌军还在正面防备汉军进攻的时候，吴汉突然下令进攻，汉军将士如猛虎下山，冲入敌军阵营，敌军猝不及防，顿时大乱，正面的汉军也趁机发起进攻，两面夹击之下，公孙述的军队大败，死伤无数，吴汉一举攻破夷陵，打开了进入蜀地的大门。
拿下夷陵之后，吴汉率领大军一路势如破竹，接连攻克蜀地多座城池，直逼公孙述的都城成都，公孙述惊慌失措，召集手下将领商议对策，有人建议他坚守不出，凭借成都的坚城，耗死吴汉的大军，也有人建议他主动出击，与吴汉决一死战。
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