与此同时，研究院的专家学者们，也就米路的问题展开了激烈的争论，有乐天派认为大可不必紧张，这种变异章鱼目前只发现了一只，或许全世界只有这一只，没有种族的延续，再加上章鱼的寿命是有极限的，所以这部分专家认为，时间会消灭一切，并且有可能这只变异章鱼很快就成长到极限了也说不定。
而也有持反对意见的专家则认为，要立刻杀死这只变异的章鱼，不然九八年的曼哈顿哥斯拉巨兽事件很可能会重演。
当年，一只高达90英尺的庞大怪物经过蜕变后，旋风似的从海岸线闯入美国，并直逼繁华的纽约曼哈顿区。巨兽的到来使得整个城市陷入了一片危机恐慌之中，当地居民面临着一场巨大的灾难。
军方为了平息混乱和恐慌，想尽办法要消灭这个庞然大物。
总之，各路人马都是各怀目的。
而最后，哥斯拉准备大量繁衍后代的巢穴被发现，如果再不加以制止，它所到之处将全部化为废墟，形势愈加严峻，不容迟疑。于是，在科学家、新闻记者、电视台摄影师、保险公司的核查员，甚至军队联合在一起，并且携手同心的无间配合最终消灭了巨兽哥斯拉的它的后代。
即便是这样，依然有漏网之鱼存在，好在造成的损失不大，这个唯一的幸存者很快便被清理现场的军方人员发现，在损失了几名士兵后，这个漏网之鱼最终被军方消灭了。
曼哈顿巨兽事件已经过去了二十年，但是造成的影响依旧存在。
虽然专家们通过已采集到的变异章鱼肉体组织，目前可以分析出这只变异章鱼此时是单纯的雄性。
但是不排除等到了繁殖期后会不会同那只哥斯拉一样，自动突变为双性繁殖体，甚至更可以大胆假设，万一，这只变异章鱼与其他普通章鱼没有生殖隔离呢？
如果到时候真的发展成那种情况，那么在场的诸位，将全部都会成为人类的罪人
但是，真就真没直接杀死变异章鱼，就连反对派的专家也觉得可惜。
就在这些海洋专家们左右纠结之际，政府方面来了一伙人。
他们自称是政府成立的秘密组织，帝王组织。
大部分的专家们都没有听说过这个组织，但是，整个实验室研究团队的负责人，米蕾妮，是恰好知道这个组织的。
帝王组织是基于帝王计划而成立的秘密组织，而帝王计划是二战后杜鲁门政府任内启动的一项探索未知生命的计划。
杜鲁门的签名授权书，里面提到“帝王组织”的主要任务，是消灭太平洋中出现的那些对军队、美国人民和美国国家安全造成威胁的未知生命。并授权使用原子弹来执行该项消杀任务。这也就是后来的“帝王计划”。
为了避免引起公众恐慌，“帝王组织”行事非常隐秘，一直对外宣称是“帝王船运公司”，由麦克将军直接管辖。
当时帝王组织主要的针对目标是哥斯拉，当然，并不是九八年大闹曼哈顿的那只变异蜥蜴哥斯拉，而是以核能为食的远古生物哥斯拉，只是，计划失败了，无往不利的核弹对远古生物哥斯拉根本不起作用！
当时人们还不知道哥斯拉这类远古生物以核能为食，并以为核弹一定能完成任何消杀任务。但在一系列核打击中吃核能吃得很爽的哥斯拉，又悄悄潜回深海。帝王组织因此被暂停获得拨款，计划无限期搁置。组织成员生活在阴影中，即使对家人也隐藏自己的真实身份。
哥斯拉潜回深海后，帝王组织的工作就似乎不那么重要了。由于它是杜鲁门总统以“非正式”拨款的方式建立，从未被视为官方团体。因此，帝王组织没有稳定的专项拨款，如果不是骷髅岛被卫星拍照发现，恐怕就没有下文了。休斯敦·布鲁克斯追随比尔·兰达一起来到了骷髅岛，他们在那里发现了“金刚”，帝王计划重新启动。
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