其后百年光阴，飞天御剑流起起落落，但总体上呈开始逐渐衰败下去。
当时看到这段历史的比古清十郎还在想，为何会发生什么这样的事情？
现在看来，当时飞天御剑流的继承人，在面对时代的浪潮，做出了犹如剧中比古清十郎一样的选择吧。
不同于执念要用手中之剑拯救世人的绯村剑心，飞天御剑流的继承人看的很明白，退去地也很自然。
“已经病入膏肓了，时代如此，人心也是如此。”
先不论一把剑能在整个时代掀起多大的浪花，飞天御剑流的继承人首先看到的，恐怕也和剧中的比古清十郎看到的世界一样。
这种乱世，飞天御剑流的加入，不过只是沦为政客手上的一把利剑罢了。
就像《追忆篇》中表现的那样。
每个人都有自己生存的执念，且皆是有自己所持有的正义。
站在历史的洪流之外，我们很清楚的就能知道，自己该做什么，该选择什么。
可身处乱世之中的人却不知道。
飞天御剑流的继承人并不清楚站在哪一方，才是正义的一方。
为了不使流派沦为杀人之剑，所以飞天御剑流退出了历史的潮流。
比古清十郎很难说，这样的做对或者不对。
不过，当看到剑心与巴的故事后，比古清十郎也清楚了一件事情。
追忆乱世时刀剑的锋芒，滚烫的斗志，还不如放在当下，从‘杀人剑’变为‘活人剑’。
至少这样的话，这世间的悲剧也就不会那么多了。
“真庆幸啊，现在是个和平的时代。”
比古清十郎喃喃自语道：“剑客虽无需消失，但却是该做出改变了，以往的执念，都该放下了…这个时候，要是有杯酒就好了。”
另一侧，同为一名剑客的斋藤佐一默然无言。
回顾祖父的手册，那个风云诡谲的幕末时代，祖父的心愿，既有身为剑客的荣光，也有贯彻‘恶即斩’的信念。
他认为他所看见的邪恶就必将斩去，留给时代的一面，只需好的一面。
以至于后面，成为明治政府的警察后，他依然贯彻着自己所持有的信念，期待着和平时代的降临。
“追忆仅是追忆，这个时代，尚且和平美好，如你所愿。”
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