便回转天山草庐，于草庐之中，将擎天剑与撼宇剑合一，以此接引姬发三魂，姬发三魂受到接引，回归其身，又因姬发自身练有轩辕黄帝所传先天乾坤功，又有女娲娘娘所传浑天宝鉴，与恢复原貌的轩辕剑共鸣，引得人道龙魂重回剑身，更进入姬发之体，将其命格激发，引动紫微帝星，将姬发之境界推动至近神。
姬发恢复神智，众人大喜，也因姬发得了轩辕剑认可，成了轩辕黄帝的传人。
姬发醒后对凌绝顶说道：“此番姬发能醒来，全赖轩龙先生之助，又闻先生要在姬发恢复后，再提出一件事，不知这一件事为何事，只要不违背天地正道，姬发自身的道德准则，姬发一并应允。”
凌绝顶对姬发说道：“你这小孩子，倒是口气不小，那我就只有一件事，待你推翻商朝之后，好好对待百姓即可，我倒是没有什么事要能帮忙的。”
“如此，便多谢轩龙先生宽厚，姬发在此立誓，若以后姬发推翻纣王之暴政，肯定好好对待百姓，以复尧舜禹时的圣明之世。”姬发开口道。
随后姬发等人拜别凌绝顶，回转西岐，而姬发大哥姬考则去朝歌救父，却惨遭纣王毒手，死于朝歌。
西伯侯姬昌从朝歌逃回西岐后，励精图治，却因纣王将其功元命元吸食殆尽，使得姬昌功体尽毁，最终于九十七岁逝于西岐。
姬昌死前将侯位传于姬发，姬发自立为王，国号西周，自号武王，追封姬昌为文王，任命太公望，周公旦，召公奭等人治理国家，周国日益强盛。
背负国仇家恨的姬发于轩辕剑中领悟出一套足以于纣王相抗衡的天剑神功，于是高举义旗，兴兵伐纣。
朝歌城外，牧野之郊，一场关乎天下苍生命运的战争即将开始。一者是统治天下九州的末代之主帝辛，一者是轩辕黄帝之传人姬发，二人之间展开了一场生死之战。
帝辛引动商朝皇陵之中的龙气，汇合自身龙气铸成不灭龙体，紫微帝心与天罗魔罟以此抗衡轩辕剑之锋芒。
但被姬发引动自身紫微帝星的命格，克制其紫微帝心，又以轩辕剑中人道龙魂斩破其不灭龙体，最后以天剑神功将纣王击败。
帝辛战败之后于摘星楼自焚身亡，但其怨气汇合天外魔珠铸成魔兵帝恨。
而姬发则在之后顺应天命，登临天下共主之位，定都镐京，建立西周成为周武王。
在这之后姬发分封诸侯，安定天下，于克殷三十年后，天命圆满，将其王位传于其子涌，又让其弟周公旦，与太公望辅助，便飞升六天之界而去。
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