银河系内，启动能源转移程序的特制星舰在升空过程中，遭遇孢子群组成的“熵晶巨网”拦截。星舰的反熵能护盾在接触巨网的瞬间开始剧烈腐蚀，工程师们紧急启动备用方案，将舰体改造为巨型“熵净声波发射器”。当发射器发出的净化音波震荡整个星系时，巨网出现裂痕，但孢子群迅速重组，化作无数携带病毒的“熵晶飞虫”，它们钻进星舰的能源管道，试图引爆核心。船员们只能穿上简易防护装备，手持激光切割器，在充满腐蚀性气体的管道中与飞虫展开肉搏。
林深在维持时空调解矩阵的同时，通过熵时沙漏的回溯能力，发现织机守护者的堕落远比想象中复杂。在远古时期，原始织机因超负荷运转产生自我意识，企图通过毁灭旧宇宙来创造更完美的新秩序。熵时仲裁者组织为阻止灾难，用织机之心将原始织机封印，但部分失控的织机碎片坠入熵暗深渊，逐渐孕育出如今的守护者。更惊人的是，孢子群的核心竟与原始织机的毁灭程序共享同一意识源，这意味着一旦孢子完成对宇宙的侵蚀，原始织机将彻底苏醒。
夏辰的熵序共振干扰器成功捕捉到熵金复合体的能量波动规律，他将其转化为可逆向运行的“秩序回滚算法”。当算法注入干扰器时，部分熵金复合体开始分解成原始的金色丝线与熵暗粒子。但织机守护者立即启动备用方案，从宇宙各处抽取恒星能量，在干扰器周围形成能吞噬一切秩序的“熵暗漩涡”。夏辰不得不将自己的意识与干扰器核心绑定，以精神力强行维持算法运转，他的身体逐渐被反秩序能量覆盖，皮肤开始出现金属化的裂痕。
洛璃在音熵箭矢撕开通道后，带领剩余音灵族成员组成“音律突击队”，顺着通道直捣织机守护者本体。当他们抵达祭坛时，发现守护者的机械巨像正在通过“熵暗核心”，将吸收的文明能量转化为新的孢子。音灵族战士们奏响“毁灭之音”，试图破坏核心，但巨像表面瞬间升起由音熵逆流构成的防护盾，将所有音波反弹回来。洛璃意识到常规攻击无效，她取出从宇宙弦获取的“创世八音”，以自身为媒介强行融合，整个人化作散发七彩光芒的“音熵熔炉”。
艾雅在解析情感控制图谱后，发现织机守护者利用了文明间的“情感落差”——当某个文明对其他文明产生羡慕、嫉妒等负面情感时，孢子就能趁机侵入其意识网络。她联合全宇宙的心理学家与哲学家，发起“情感共鸣计划”，号召文明间分享各自的历史、文化与梦想，用真实的情感交流填补落差。随着计划的推进，无数文明通过量子通讯展开“情感对话”，网络中的负面情绪实体开始逐渐消散。但就在局势好转时，孢子群突然释放出终极武器“情感熵弹”，这种炸弹一旦引爆，将彻底摧毁所有文明的情感共鸣能力。
神秘战士面对机械巨像，混沌本源在剧烈燃烧中竟产生异变，他的身体开始与混沌终焉戟产生意识融合。当戟刃刺入巨像关节时，他能清晰感受到守护者的记忆——那是被熵暗之力扭曲的守护执念，以及对原始织机疯狂的忠诚。巨像的反击震碎了他的铠甲，露出胸口处浮现的混沌图腾，图腾突然发出耀眼光芒，将周围的熵暗能量转化为纯粹的混沌之力。神秘战士借此机会，将混沌能量注入巨像的核心接口，试图从内部瓦解其结构。
在宇宙的另一角落，那座神秘祭坛上的黑袍人完成了最终仪式。他们的身体开始分解成无数发光丝线，这些丝线汇聚成一个巨大的“织机虚影”。虚影挥动织机，整个宇宙的时空开始出现褶皱，那些被孢子侵蚀的区域，逐渐被编织成一个巨大的“熵寂茧房”。更可怕的是，原始织机的毁灭程序进入最终倒计时，宇宙各处的熵暗核心同时亮起，形成一张覆盖全宇宙的死亡网络。
林深在矩阵即将崩溃之际，终于破译了织机之心的全部秘密。原来这颗心脏不仅是能源核心，更是原始织机的“情感中枢”——只有当全宇宙文明怀着共同的信念与希望注入能量时，才能启动织机的自我净化程序。他通过量子通讯向所有文明发出最后的号召，同时将熵时沙漏与织机之心完全融合，在时空调解矩阵中开辟出“信念传输通道”。夏辰、洛璃、艾雅、神秘战士以及无数奋战在一线的战士们，纷纷将自己的力量与信念注入通道。
当信念之力汇聚成璀璨星河时，织机之心爆发出前所未有的光芒。光芒所到之处，孢子群开始分解，熵金复合体化为齑粉，织机守护者的机械巨像也在光芒中逐渐崩解。但原始织机的毁灭程序并未停止，倒计时的最后时刻，林深将全部力量注入织机之心，启动了“宇宙重启协议”。整个宇宙在剧烈震荡中开始回溯，时间与空间重新编织，那些被毁灭的文明、消逝的生命，都在光芒中逐渐复苏。然而，在重启的光芒深处，一个更加神秘的存在正注视着这一切，它的轮廓若隐若现，似乎在等待着下一次的降临……
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