十万年前的一场圣战，冥王和雪皇相继被封印。七大平行宇宙迎来了十万年的平静。
十万年过去了，冥王将在七天后苏醒，届时，七大平行宇宙将迎来一场末日浩劫。为了阻止这场浩劫，四位满怀信念的超兽战士义无反顾地踏上消灭冥王之路。可惜，当他们要出手毁灭冥王的一刻，也正是冥王完全苏醒的时候。
超兽战队全部被冥王打入玄冥黑洞的内部，在逆境中大家遇到雪皇等人，众人合力一起冲出了玄冥黑洞。
冥王和雪皇两个宿敌展开激战，即将同归于尽之际，几位超兽战士出手相救，却被卷入虫洞，意外回到十万年前，他们面对着自己不为己知的过去，作为超兽战士的信念逐渐崩溃，他们必须重拾信念，认识自己真正的使命。
在超兽武装的世界观里，总共存在着七个互相平行的宇宙。这些平行宇宙之间有着高度的相似性，在其他的平行宇宙中可能会存在与自己的平行宇宙一模一样的个体，但平时七大平行宇宙之间只能通过虫洞来进行相互穿越，并且虫洞会存在非常巨大的引力，可以毁灭一切外来物质，所以需要有很强的承受能力才可以穿越各个平行宇宙。
而每隔十万年，七大平行宇宙就会因为自身强大的引力而联通在一起，并持续七天的时间，在这七天之内，只要有足够强大的异能量，就可以穿梭于各个平行宇宙之间，而不需要再局限于通过虫洞来穿越各个平行宇宙。七天之后，七大平行宇宙就会再次分离，在这期间，谁的信念足够坚定和强大，谁就可以进入永恒轮回，而信念最强者甚至能将他的信念灌输到七大平行宇宙，从而达到统治世界的目的。
第一宇宙
火麟飞、苗条俊和玄易子所存在的世界，天羽也在这个世界长大，在这个世界主要生活着人类。这里也出现了与其他超兽战士完全相同的个体，包括天羽、龙戬、泰雷、夜凌云、风耀、风影、baboo、龙莹等等，验证了各个平行宇宙之间有着极大的相似性的理论。
第二宇宙
龙戬所存在的世界，冥界四大护法之一的蝎子王龙莹也归属于此。在这个世界生活着龙族，龙族又分成了白龙族和青龙族。十万年前龙族爆发了内战，白龙族被青龙族灭绝；十万年后，白龙族最后的遗孤龙莹又将青龙族灭绝。
第三宇宙
泰雷所存在的世界，冥界四大护法之一的鲸鲨王也归属于此。这里的地球是一个沙漠星球，并且社会制度还停留在奴隶制，在这个世界生活着金象族和鲸鲨族。十万年前金象族占据着统治地位，并且有第七平行宇宙的白虎族部队作为支援，鲸鲨族则作为奴隶阶层。后来鲸鲨王在泰雷和元正的帮助下，带领鲸鲨族奴隶成功地推翻了金象族的统治，使鲸鲨族和金象族暂时处于平等地位。十万年后鲸鲨族已经转而占据了统治地位，金象族变成了奴隶阶层，鲸鲨王则成为了冥界四大护法之一。
第四宇宙
夜凌云所存在的世界，这里的地球的地理环境非常特殊，磁场会频繁的交换两极，从而产生强大的电磁干扰，会对来自其他平行宇宙的战士进入超兽武装状态产生影响。在这个世界生活着云蝠军团，也是归属于冥界的族群势力之一。十万年前，云蝠军团是七大平行宇宙中个体作战能力最弱的部队，此时夜枭子是云蝠军团的领袖，后来夜凌云夺取了领袖位置，并使云蝠军团练习了巨能云蝠阵。十万年后，云蝠军团已经成为七大平行宇宙中战斗力最强的部队，夜凌云也成为了冥界四大护法之一。
第五宇宙
冥王所存在的世界，天羽、狮王也归属于此。这里的地球又被称为冥界，地理环境极其恶劣，并且存在着一股很强的黑暗引力，除了放松身体化解这股引力之外，就只有强者才能够挣脱引力的吸引。在这个世界主要生活着狼族和狮族，也有凤凰族等其他族群的存在。
第六宇宙
Baboo所存在的世界，在这个世界生活着Baboo家族。这里的地球环境非常优美，Baboo家族也是生性善良、热爱和平的族群。但因为每只Baboo都具备很强的异能量，并且整个Baboo家族毫无战斗能力，所以这个世界历来都是兵家必争之地。
第七宇宙
雪皇、风耀、风影所存在的世界，元正、鬼王也归属于此。这里的地球常年积雪，在这个世界主要生活着白虎族，也有后来加入的凤凰族等其他族群，基本上都归于以雪皇为首的雪宫来统领。十万年前白虎族是七大平行宇宙实力最强的族群，足以干涉各个平行宇宙。
异能量
在超兽武装的世界观里，异能量是宇宙中生命体存在的一种形式，每个生命体都会蕴含或多或少的异能量，而只有超兽战士具备远超普通生命体的异能量。异能量的数量级非常高，比普通的核能量要强大十亿倍，因此异能量以黑洞或者白洞来作为计数单位。一般情况下异能量至少要达到自身正常值的60%才可以进入超兽武装状态。
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