在晋代，一般案件在地方县衙审理，重大案件则由大理寺、刑部和御史台共同审理。大理寺、刑部、御史台是古代的三法司，其中，刑部负责审案与刑罚执行，大理寺负责复核刑部审理的案件里比较重大的案件，御史台则负责监督。
京尹是一个古代官名，是首都所在地区的行政长官。在晋代，京尹可能指的是京兆尹，其职责是掌治京师。
汉代京兆尹掌治十二县，与左冯翊、右扶风合称三辅；
吏部：管理文职官员。
户部：掌管租税钱谷和财政收支。
礼部：掌管典礼事务与学校、科举之事。
兵部：掌管武官选用及军事行政。
刑部：掌管全国刑罚政令及审核刑名。
工部：管理全国工程事务。
此外，晋朝的三公九卿分别是：
三公：丞相、太尉、御史大夫。
丞相：政府最高行政长官，有一个秘书处十三曹，总管国家运营全面。
太尉：最高军政长官，负责管理全国军事事务。
御史大夫：主要管理记事，其地位相当于副丞相，主要职责是管理图籍、奏章，监察文武百官。
九卿：奉常、郎中令、卫尉、太仆、廷尉、典客、宗正、治粟内史。
奉常：掌管宗庙礼仪。
郎中令：掌管宫殿警卫。
卫尉：掌管宫门警卫。
太仆：掌管宫廷御马和国家马政。
廷尉：掌管司法审判。
典客：掌管外交和民族事务。
宗正：掌管皇族、宗室事务。
治粟内史：掌管租税钱谷和财政收支。
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