面对蚩尤的颓势，黄帝、炎帝乘胜追击。饥肠辘辘的蚩尤部众，哪里还有继续交战的心情，纷纷四散奔逃。黄帝手下大将应龙，率领手下人马包围了蚩尤。经过激烈搏杀，蚩尤被应龙杀死。
涿鹿之野，到处是面目全非的尸体。那些被击伤的将士，有的躺在地上嚎叫，有的大哭不止。剩下的几十个部落首领，率领各自部众四散溃逃。有的逃往南方，有的逃往西方。
激烈的战事结束了，黄帝命令把俘虏带到轩辕城，并且给蚩尤手下受伤的将士医治。双方战死的将士，黄帝吩咐在合适的地方安葬。在黄帝、炎帝等人的劝说下，很多蚩尤部众愿意投降。
消灭了蚩尤，华夏联盟的势力，很快往南推进到中原地区。自此以后，炎黄联盟成了中原真正的主人。随着在一起杂居、聚居尤其是互相通婚，炎帝、黄帝和蚩尤部众，逐渐开始融合。
涿鹿之战的规模，远远超过阪泉之战。蚩尤虽然战败身死，但他在东夷、三苗等部族、部众心里，仍然是神一样的存在，所以虽败犹荣。东夷、三苗等地，都有祭祀蚩尤的祠堂或庙宇。
有人考证，涿鹿之战发生在公元前2677年。双方交战的地方涿鹿一带，既可以放牧马牛羊，也适合种植各种农作物。
蚩尤是中华民族的第一位战神，虽然身首异处，但仍然受到后世纪念。黄帝、炎帝和蚩尤，被称为华夏民族的“中华三祖”。
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