九黎族凭借先进的兵器屡屡挑起事端，横征暴敛，很快便惹怒了位于今陕西一带的黄帝部落，双方便在河南涿鹿展开大战。
起初，黄帝部落因武器不如九黎部落而屡战屡败，有“黄帝与蚩尤九战九不胜”的传说。据《太白阳经》记载：“伏羲以木为兵，神农以石为兵，蚩尤以金为兵，是兵起于太昊，蚩尤始以金为之。”
传说蚩尤作战时能呼风唤雨，制作大雾，令黄帝部落的士兵迷失方向，无法战斗。黄帝与蚩尤战七十一仗，胜少败多，让他心中焦虑寝食难安。
一日，九天玄女于梦中赠予他兵书《阳符经》，黄帝根据书中“天一在前，太乙在后”的阵法设九阵置八门，阵内布置三奇六仪，制阴阳二遁，演习变化成为一千八百阵，取名“天一遁甲阵”，又发明了能在大雾中辨别方向的指南车，最终在决战中将蚩尤打败。这便是“天遣玄女下授黄帝兵信神符，制伏蚩尤，帝因使之主兵，以制八方。”
蚩尤战败后持佩剑九黎御风而行，黄帝一路追击却无可奈何，至冀州中部时，一名九黎族俘虏献计以夔牛皮鼓连擂九下，蚩尤顿时魂飞魄散不能行走，肉身被黄帝捉住，散乱的魂魄便进入“九黎剑”中，九黎部族一部分归降黄帝，一部分向南逃亡。
黄帝将蚩尤肉身分解，埋在天下不同地方以防九黎剑中蚩尤魂魄借尸体复生。此后黄帝部落成为中原地区的新盟主，但仍有许多部落不服，黄帝便重用归降的九黎部落将领征讨天下，同时利用蚩尤的威信震慑其他部落，中原才逐渐稳定下来。这便是《五帝本纪》中记载的“蚩尤没后，天下复扰乱，黄帝遂画蚩尤形像以威天下，天下咸谓蚩尤不死，八方万邦皆为弭服。”
山河演变，世事变迁。
归降黄帝的九黎族人经过几千年世代繁衍逐渐被华夏民族融合，最终只剩下柳氏一族守护九黎剑。
南逃的九黎族人逐渐分化，衍生出东巴族、苗族、瑶族、土族、黎氏彝族、土家族、巴族、纳西族等少数民族，而这些少数民族居住分散习俗不同，因此并不团结。
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