张伏在江南召开地方官会议，强调：“朝廷查贪腐，不分京官地方，谁要是敢包庇，就和贪腐者同罪。”他还设立了“百姓举报点”，鼓励百姓揭发贪腐官员，短短十日就收到举报信百余封，为查案提供了不少线索。
三法司会审在京城刑部大堂举行，郑衡（刑部尚书）主审，卫诵（大理寺卿）、虞谦（左都御史）分坐两侧，案上摆满了证据：账本、通信记录、赃银、工程勘察报告。涉案的温良、刘启、李嵩等二十余名官员，被押在堂下，跪了满满一地。
“温良，你牵头组织跨部门贪腐网络，涉案金额五十万两，通敌泄密，可知罪？”郑衡的声音震得堂柱嗡嗡响。温良瘫在地上，说不出话。卫凛（刑部左侍郎）呈上温良的供词：“他招认了所有罪行，包括如何拉拢各部门官员，如何截留公款。”
刘启还想狡辩：“我只是执行命令，主犯是温良。”宋昭（刑部右侍郎）拿出他截留河工款的账册：“你自己拿了五成赃银，还敢说只是执行命令？江南堤坝垮塌，淹死百姓十余人，这笔账也得算在你头上！”
卫诵（大理寺卿）宣读复核意见：“温良、刘启、李嵩为主犯，贪腐数额巨大，通敌泄密，判斩立决；王承、张彬等从犯，革职抄家，流放边疆；陶岳主动认罪，贬为庶民，退缴全部赃银。”
冯谦（刑科给事中）补充道：“此案已编入《刑案集要》，作为‘跨部门贪腐’的典型案例，警示百官。涉案官员的家产，一半补偿受灾百姓，一半投入江南河工和农桑学堂。”
温良临刑前，突然招供：“我背后还有人，是前魏党成员赵康，他让我组织贪腐网络，积累钱财，为魏党复辟做准备。”三法司立刻上报，萧桓下令由魏彦卿（内阁大学士）牵头，锦衣卫配合，抓捕赵康。
魏彦卿查到赵康隐居在京城郊外的寺庙中，表面是僧人，实则与各地魏党残孽联系。锦衣卫突袭寺庙，在佛像后搜出魏党复辟的计划书，上面写着“以贪腐动摇新政根基，以钱财招揽旧部”。
赵康供认，他利用温良在吏部的职权，安插魏党残孽到各部门，企图破坏新政：“陈言贪腐赈灾银，就是为了让百姓对朝廷不满；刘启偷工减料修堤坝，是为了让水灾更严重，动摇陛下的统治。”
沈修（翰林院编修）将赵康的罪行补充到《肃奸录》中：“魏党余孽虽隐姓埋名，但贼心不死，贪腐只是他们的手段，复辟才是目的。”萧桓下旨：“全国通缉魏党残孽，凡举报属实者，赏银百两。”
蒙傲在西北也抓获了几名与赵康勾结的边将，他们企图克扣军饷，煽动士兵哗变。“魏党残孽真是无孔不入，”蒙傲将边将斩首示众，“谁要是敢勾结反贼，就是这个下场！”
孙越（兵科给事中）在西北督查军饷，发现有边将效仿陈言，以“军屯损耗”的名义截留军饷，交给赵康的同党。“这些边将，拿着朝廷的军饷，却帮反贼做事，简直天理难容！”孙越当即上报蒙傲。
蒙傲令赵烈（西北参将）彻查边军军饷，赵烈在军屯账册中发现，三名边将截留军饷十万两，还将军粮卖给鞑靼。“军饷是士兵的命根子，军粮是边防的保障，你们怎么敢动！”赵烈将三名边将绑到军营前，当着全体士兵的面宣判斩立决。
裴衍（兵部右侍郎）改革军需采买制，规定军饷、军粮的发放，需由将领、士兵代表、兵科给事中三方签字确认：“以后每一笔军需开支，都要公开透明，让士兵们监督，绝不能再让蛀虫有机可乘。”
鞑靼得知魏党残孽被抓，边军军纪整肃，不敢再轻易犯边。赵烈站在烽火台上，望着边境线，对士兵们说：“朝廷清廉，军饷充足，我们守边更有底气了！只要我们同心协力，就没有攻不破的敌人！”
孙越将西北的军饷核查情况上报，萧桓下旨嘉奖：“孙越、蒙傲、赵烈，保边有功，各赏黄金百两。”他还令兵部将“边军军饷公开制”推行到全国，确保军饷足额发放到士兵手中。
贪腐案审结后，沈敬之在吏部推行“官员任职公示制”：凡提拔官员，需将其资历、实绩、家产公示三个月，接受百姓监督；还设立“廉政档案”，官员的贪腐记录终身留存，影响升迁。
徐英在户部改革财税制度，将盐课、漕运、河工等款项纳入“专项账户”，由户部、六科给事中、地方官共同管理，支出时三方画押：“这样一来，任何一笔款项的流向都清晰可查，想截留都难。”
冯衍在工部建立“工程终身追责制”：谁主持的工程，谁就终身负责，若出现质量问题，无论是否离任，都要追责。“江澈主持的江南堤坝，以后要是出问题，就算他升了尚书，也要被问责。”冯衍解释。
虞谦在都察院设立“跨部门监察组”，由六科给事中轮流担任组长，定期督查各部门工作，发现贪腐苗头及时查处：“贪腐网络往往跨部门，监察也得跨部门，才能形成震慑。”
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