秦昭赞同道：“于侍郎所言极是。此外，需制定明确的军饷标准——军户丁壮按服役年限定军饷，募兵按战力等级定军饷，战时军饷加倍，论功行赏需及时兑现。同时，要整肃大同卫原有军官队伍，对贪腐、不作为者一律查处，选拔实干有功者任职。”
谢明也同步在户部制定财政保障方案，他令户部左侍郎秦焕核算专项预算，明确军饷、土地清核、招募奖励等各项开支；令户部右侍郎方泽协调漕运，确保大同卫军粮供应充足。同时，推行“三重核查制”，由户部、都察院、兵部各派官员组成核查小组，监管资金使用。
都察院左都御史虞谦得知改革方案后，主动选派十名精干御史，随于擎赴大同卫，负责督查土地清核、军官整肃与资金使用情况。虞谦叮嘱御史：“卫所改革关乎边防稳固，若有官员借机贪腐、阻挠改革，务必严查严办，即刻上报，不得姑息。”
筹备期间，萧燊多次召见秦昭、于擎、谢明等人，询问筹备进展。当得知各项工作有序推进，方案细节不断完善后，他叮嘱道：“改革试点难免遇到阻力，诸卿需灵活处置，既要坚守原则，又要安抚民心。尤其是原有军户，不可因改革而寒心，要让他们感受到新政的益处。”
三日后，于擎率领兵部官员、都察院御史及首批筹备物资，启程前往大同卫。抵达大同卫城时，眼前的景象令人揪心：卫所营寨破败，兵士多为老弱，衣甲陈旧，操练松散；城外流民聚集，面黄肌瘦，不少人曾是逃亡的军户子弟。
大同卫指挥使郑彪率下属官员迎接，态度看似恭敬，实则暗藏抵触。于擎不动声色，先查阅卫所军户名册与土地账簿，发现名册与实际人数严重不符，土地账簿混乱，多处军田被标注为“荒田”，实则被郑彪等军官侵占。
当晚，于擎召集大同卫各级军官议事，直言道：“本侍郎奉陛下之命，赴大同卫推行卫所改革试点，推行‘军户+募兵’双轨制。首要之事，便是清核军户、归还军田、整肃军纪。凡主动交出侵占军田、坦白问题者，可从轻处置；若有隐瞒、阻挠者，严惩不贷！”
郑彪心中一紧，却仍强辩道：“于侍郎，军田荒芜已久，下官等也是为了盘活土地，才暂借耕种，并非侵占。且军户逃亡是常态，清核难度极大，恐难推进。”一旁的都察院御史当即反驳：“郑指挥使，土地账簿与实际情况不符，多处‘荒田’实则肥沃，你还敢狡辩？今日便先查封账簿，明日起逐一核查土地！”
于擎见状，当即下令：“即刻查封卫所土地账簿与军户名册，由兵部与都察院官员共同看管；明日起，分三组开展工作：一组清核军户，登记实际人数与情况；二组核查军田，实地勘察，确认归属；三组巡查营寨，整肃军纪，清点军备。郑指挥使，你需全力配合，不得有误！”
次日，清核工作正式启动。于擎亲自带队核查军田，每到一处，便召集当地农户与军户核实情况。不少军户因惧怕郑彪报复，起初不敢直言，于擎当即承诺：“陛下推行新政，旨在安抚军户、稳固边防。凡举报侵占军田者，一律保密；被侵占的军田，必全额归还；涉案官员，绝不姑息！”
在于擎的承诺与御史的震慑下，终于有军户站出来举报。经查，郑彪及其下属五名军官，共侵占军田两千余亩，将其转租给农户，收取高额租税。此外，还存在克扣军饷、虚报兵额冒领军饷等贪腐行为。
于擎当即下令，将郑彪等六名涉案军官革职查办，押入大牢。同时，张贴告示，公布郑彪等人的罪行与改革政策，宣布归还被侵占的军田，按军户丁壮数量重新分配。消息传开，大同卫军户无不欢呼雀跃，纷纷主动配合清核工作。
清核过程中，于擎发现不少逃亡军户因无田可耕、生活无着而流落四方。他当即上疏朝廷，请求允许逃亡军户子弟返乡，重新登记入籍，分配军田，免除既往罪责。萧燊准奏后，于擎即刻张贴告示，召回逃亡军户子弟。
经过十日的紧张清核，大同卫军户与土地情况终于厘清：实际军户两千二百余户，丁壮一千五百余人；共清退被侵占军田两千三百余亩，重新分配给军户；查处贪腐军官八名，整肃了军官队伍。大同卫的风气，初步得以扭转。
清核工作结束后，于擎正式推行“军户+募兵”双轨制。针对原有军户，他落实优化待遇政策：按丁壮数量分配军田，配发农具与种子；免除军户额外赋税，军饷按月足额发放；选拔年轻力壮的军户子弟，开展集中操练，提升战力。
同时，启动募兵工作。于擎在大同卫城内外张贴募兵告示，明确招募条件：年龄十六至三十五岁，身体健康，勇武有力；流民、逃亡军户子弟优先；军饷按战力等级分为三等，最高等军饷是原有军户的两倍；服役满五年且表现优秀者，可晋升官职或脱籍为民。
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