起初，将士们难以适应这种高强度、重实战的训练模式。不少将士早已习惯了以往“摆样子、走过场”的形式化训练，每日只需列队操练、喊喊口号便能应付了事，如今突然要在泥泞的滩涂地带进行高强度的战术演练，不仅体力消耗巨大，还要时刻牢记战术配合要点，一时间难以适应。训练中，不少将士动作僵硬、反应迟缓，小队配合更是生疏混乱，在模拟攻防演练中屡屡被“倭寇”突破防线，纷纷“阵亡”出局。休息间隙，有士兵私下抱怨：“以往训练多轻松，只需摆摆样子就行，如今这般累得像条狗，实在吃不消！”甚至有几名资历较老的老兵，觉得新训练模式“不成体统”，联合起来找到营将诉苦，请求恢复旧有的训练模式。
营将深知革新乃是天子旨意，不敢擅自更改，又难以安抚将士情绪，只得将情况紧急上报至兵部。秦昭得知消息后，深知此事若处理不当，极易引发连锁反应，影响全国革新推进，当即决定亲自赶赴浙江营地督导。抵达营地后，秦昭并未急于严厉斥责抱怨的将士，而是先深入训练场，实地观察了将士们的训练情况。随后，他召集全体将士列队集合，站在高台之上，语气沉重地讲述了沿海百姓遭受倭寇蹂躏的惨状：“你们可知，就在上个月，台州府一个村落遭倭寇突袭，全村百余口人几乎被屠戮殆尽，房屋被烧，粮食被抢，孩童啼哭、妇人哀嚎之声不绝于耳！你们每一次训练松懈，每一次敷衍了事，都可能导致下次作战失利，而失利的代价，就是无数百姓流离失所、家破人亡！你们身着军装，肩负的是守护百姓安宁的重任，岂能贪图安逸！”随后，他又让陈峰分享与倭寇作战的亲身经历，陈峰讲述了自己战友为守护百姓战死沙场的事迹，声泪俱下。将士们听后，无不羞愧动容，纷纷低下了头，抱怨之声瞬间消散。
秦昭趁热打铁，当场宣布推行“奖惩并行”的训练制度：训练成效显着、考核优异者，优先晋升官职、发放丰厚奖金，其家属可享受朝廷抚恤优待；消极怠工、考核不合格者，予以通报批评、扣除军饷，情节严重者直接贬斥除名。同时，他要求陈峰等教官根据将士体质、基础差异，制定个性化训练计划，循序渐进提升训练强度，避免因强度过大导致将士抵触。此外，秦昭还特意调拨一批精良的铠甲、兵器发放给将士们，改善训练装备。一系列举措下来，有效激发了将士们的训练热情，营地内的抱怨声彻底消失，取而代之的是刻苦训练的呐喊声，迅速掀起了一股全员练兵的热潮。
类似的阻力在西北边防驻军也有出现。西北将士常年习惯了与鞑靼骑兵进行正面阵地战，对实战化训练中的灵活战术与协同配合难以适应，不少将士同样产生了抵触情绪。兵部右侍郎于擎亲自前往西北边防督导，他深知强行压制只会适得其反。抵达营地后，于擎结合西北边防的实际情况，组织将士们开展“模拟骑兵突袭”实战演练：挑选一批精锐将士组成模拟鞑靼骑兵小队，配备鞑靼样式的装备，采用鞑靼“快进快退、迂回突袭”的战术发起进攻。演练中，习惯了旧有战术的守军将士频频受挫，深刻体会到了旧有训练的弊端与实战化训练的必要性。随后，于擎又组织教官为将士们详细讲解鞑靼的战法特性与应对技巧，耐心引导将士们转变训练观念。在将领们的耐心引导与奖惩制度的激励下，西北驻军的抵触情绪逐渐消解，训练也逐步走上正轨，将士们的实战技能开始稳步提升。
军事训练实战化革新在全国范围内稳步推行之际，各地百姓也通过各种途径深切感受到了朝廷备战御侮的坚定决心。江南地区，此前因教务规范革新重获土地的农户们，听闻沿海驻军正全力开展抗倭实战训练，纷纷自发组织起来，带着自家种植的粮食、采摘的蔬菜以及精心缝制的衣物，前往沿海军营送粮送水，慰问辛苦训练的将士们；西北边境，边民们目睹边防将士冒着风沙刻苦演练防御鞑靼的战术，深受触动，主动捐出家中的马匹、粮食以及积攒的钱财，支援军队训练，不少边民还自发组织起来，为军营运送物资、修缮防御工事。军民同心备战的温馨场景，在大吴各地不断上演。
苏州府城郊，年过六旬的百姓李老汉，曾因当地寺庙侵吞田地而流离失所，一家人四处乞讨，苦不堪言。幸得朝廷推行教务革新，侵占的田地被重新归还农户，李老汉一家才得以重返故土，开垦耕种，重新过上了安稳的日子。当他从前往县城赶集的乡邻口中听闻朝廷推行军事革新、全力备战抗倭御鞑的消息后，心中百感交集，当即召集邻里乡亲齐聚自家院落商议。李老汉拄着拐杖，站在院中高台上，声音略显沙哑却无比坚定：“陛下推行仁政，帮我们夺回了田地，让我们安居乐业。如今国逢外患，朝廷厉兵秣马抗敌，守护我们的家园，我们百姓也理应尽一份绵薄之力！”在场的乡亲们纷纷点头附和，一致赞同李老汉的提议，决定联合全国各地的百姓，联名呈递请奏疏，既向天子表达感恩之情，也为朝廷备战助力。
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