夕阳的余晖洒在崎岖的山路上，小智一行人正驾驶着房车艰难前行。突然，前方的树丛中传来一阵诡异的嗡鸣声，数十只闪烁着危险红光的顽皮蛋从四面八方涌出，将房车团团围住。
快把房车往后退！小智猛地拍打驾驶座，额头渗出细密的汗珠。他敏锐地注意到这些顽皮蛋的异常之处——它们的金属外壳上全都刻着相同的编号，行动模式也如出一辙。皮卡丘，小心那些顽皮蛋！皮卡丘竖起耳朵，脸颊的电气袋迸发出噼啪作响的电光。
小刚迅速掏出图鉴，镜片反射着冰冷的数据流：这些顽皮蛋...体温比正常值低了3.2度，生命体征波动完全同步。他推了推眼镜，声音变得凝重，小智说得对，它们都是人工制造的复制体。
数量这么多，绝对不可能是野生的。小刚皱着眉头分析道，手指在控制面板上快速滑动，调出周边地形图，更可疑的是，这片区域根本没有顽皮蛋的栖息记录。
与此同时，在二十公里外的一处隐蔽峡谷中，火箭队三人组正站在一座爬满藤蔓的金属大门前。潮湿的空气中弥漫着刺鼻的机油味，武藏的高跟鞋踩在生锈的铁板上发出令人牙酸的声响。
喵，就是这里了！武藏兴奋地挥舞着手中的老旧蓝图，红色长发在幽暗的隧道中格外醒目，那个被组织除名的疯子科学家，最后就躲在这个秘密基地里。
小次郎用手电筒照亮角落，突然倒吸一口凉气。在布满灰尘的控制台上，一个篮球大小的球形装置正散发着诡异的蓝光，无数电缆像血管般连接着四周的仪器。能产生无穷无尽电力的永动机...他的声音因激动而颤抖，这可比抓皮卡丘有价值多了！
喵喵的爪子轻轻拂过装置表面的铭文，突然瞪圆了眼睛：这上面写着...宝可梦复制计划它猛地转头看向隧道深处，那里传来机械运转的轰鸣声。
就是这样！三人异口同声地喊道，志在必得的笑容在忽明忽暗的灯光下显得格外狰狞。武藏从腰间取下精灵球，金属外壳反射着冷冽的寒光：等我们拿到这个装置，看坂木老大还敢小瞧我们！
您好，我是君莎警官。君莎小姐微笑着向小智伸出手，阳光透过警车的车窗在她英气的面庞上投下斑驳的光影。她身着笔挺的蓝色制服，胸前的警徽在阳光下闪闪发亮。您就是小智吧？现在整个联盟都在传颂您的事迹。她的声音里带着由衷的敬佩，自从您挫败了火箭队的阴谋后，联盟就下达了特别指令，只要发现您的行踪，我们都会全力保护您的安全。您可是联盟最...
哼，那个老家伙总算做了件好事。小茂双臂交叉在胸前，语气中带着几分不屑，但眼中却闪过一丝不易察觉的关切。他修长的手指轻轻敲击着手臂，转头看向四周，眉头微皱：不过，这些顽皮蛋是怎么回事？只见街道上密密麻麻地挤满了顽皮蛋，它们圆滚滚的身体反射着金属般的光泽，时不时发出的电流声。
小健也凑上前来，推了推鼻梁上的眼镜，满脸疑惑地打量着周围：数量这么多...难道是...他的声音因为震惊而微微颤抖，手中的素描本差点掉落在地。
没错，这些都是复制体。小智神色凝重地解释道，皮卡丘在他肩头不安地抖动着耳朵。他轻轻抚摸着皮卡丘的绒毛，继续说道：有个疯狂的博士为了研究某种电力装置，用顽皮蛋做实验。他的目光扫过街道上成群的顽皮蛋，声音低沉：结果实验失控，意外复制出了大量顽皮蛋。现在整个城市都...
小霞...小智欲言又止地看向同伴，眼中流露出复杂的情绪。小霞立即会意，粉色的长发在风中飘扬，她急切地追问道：那个博士现在怎么样了？她的手指不自觉地握紧了腰间的精灵球。
下落不明。小智摇摇头，语气沉重得仿佛能滴出水来。远处的顽皮蛋群突然同时闪烁起危险的电光，照亮了他紧绷的面容。他...已经完全失去理智了。据说他把自己也改造成了...话未说完，一声震耳欲聋的爆炸声从不远处的实验室传来，滚滚浓烟中隐约可见一个扭曲的人形轮廓。
就在这千钧一发之际，天空中突然传来一阵刺耳的引擎轰鸣声。只见一架造型怪异的飞行器划破云层，火箭队三人组以夸张的姿势从天而降，红色的R字披风在风中猎猎作响。喵~这些神奇宝贝，我们全部都要回收！喵喵得意洋洋地挥舞着手中的黄色方块，那是一个闪烁着危险红光的能量控制器。
是少爷！武藏和小次郎异口同声地喊道，两人单膝跪地做出夸张的效忠姿势。他们身上穿着崭新的战斗服，胸口镶嵌着复杂的机械装置，显然经过了全面升级。
又是你们火箭队！小智皱着眉头喊道，下意识地护住身后的顽皮蛋群，能不能别老是阴魂不散地跟着我们？他的声音中带着明显的恼怒，额头已经渗出细密的汗珠。
小丫头，我们可不是跟着你，武藏叉着腰，趾高气扬地说，她新染的紫色长发在阳光下泛着金属般的光泽，我们是为了少爷才来的！说着她按动手腕上的装置，地面突然裂开，数台机械臂从地下伸出。
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