南赣道汪报闰在春季于泰和剿匪失利，退守赣州。多隆阿、遮克敦布均率溃败兵勇入城协助防守。敌军多次进犯赣州城，均被击退。五月，广东援军抵达赣州入城驻守。当月，官军出城攻破敌军营地，平定战事，赣州解除戒严。
三十日，曾国藩紧急上奏抚州战况一折，建昌府城西面战况一折，并为阵亡都司黄虎臣请求抚恤。随折保举李大雄、胡应元、江永和三员将领。又上奏水师收复南康府城一折。另奏报饶州失守后旋即收复一折。布政使耆龄专责饶州防务，与知府张澧翰等本应受处分，但因迅速克敌，奏请免予追究。
为阵亡将领李鹤龄、李遐龄请求抚恤。另附片奏报福建援赣部队已抵达建昌者共二千六百人；湖北援军已攻克新昌、上高，两湖地区军情联络得以恢复；广东援军已进驻赣州，当可确保这一战略要地安全。此前敌军四处活动，赣州、吉安、袁州、瑞州等地军情长期无法传至南昌，至此各地通讯逐渐恢复畅通。
太平军进入江西后，清军水师屡次阻击获胜，使其难以得逞。于是太平军在吉安、袁州、瑞州、临江等地赶造战船，制造攻城器械，趁夏季河水暴涨之际，集中兵力进犯南昌。他们在瑞河口、临河口、塘头堎、生米司等地都设立了营垒。七月初一，太平军战船顺流而下发动进攻，刘于浔率水师在瑞河口迎击，成功将其击退。
湖北援军抵达瑞州。初二日，在城西门外扎营。初三日，攻克瑞州南城。曾国藩派军迎接援军时，太平军主力进犯省河西岸，在沙井一带修筑营垒。初四日，营官羊瀛、万泰、胡应元、李大雄、滕加洪率领五营兵勇渡河进攻，击溃敌军。
初五日，援军进攻瑞州，未能攻克。水师攻打生米司的敌军营垒，敌军溃败逃走。
初九日，彭山屺、李新华率军拔营前往瑞州。瑞州城内的敌军多次出城袭击援军营地，均被援军击退。
湖北援军中刘腾鸿的谋略和勇略最为突出。曾国藩派彭山屺、羊瀛等率领四千兵勇，委任彭山屺总理营务，又命训导罗萱兼管各营事务。十五日，部队抵达瑞州与援军会合。曾国藩命罗萱与刘腾鸿合为一营，以联合江西、湖北两军的力量。十七日，瑞州敌军出城袭击军营，江西军稍退，刘腾鸿、普承尧率军将其击退。
曾国藩的弟弟曾国华因在酷暑中行军，病情严重，乘小船到南昌见曾国藩，曾国藩既感伤又欣慰。吴坤修一同到南昌领取军饷，随后返回瑞州。曾国藩与文俊共同筹措拨发白银五千两，用以犒劳援军。曾国华留在南昌养病，十余日后逐渐康复。
二十七日，瑞州敌军出城袭击军营，湖北军与江西军合力将其击退。
彭玉麟率领水师在南康攻击敌军，将其击溃。刘于浔的水师在临河口袭击敌军船只，取得胜利。
二十八日，水师进攻临河口的敌军营垒，全部攻克。
收复饶州时，都司毕金科战功最为卓着。布政使耆龄上奏弹劾毕金科，曾国藩与文俊商议后调布政使回省城任职，委派毕金科驻守饶州负责防御和剿匪事务。
湖北援军抵达瑞州后，新昌、上高两县仍被敌军占据，吴坤修率军收复这两座县城，随后回师清剿奉新敌军，作为援军的机动部队。
当月，吉安与建昌交界处出现边钱会匪乱，他们勾结广东流窜的太平军残部，聚集了一千多人，先后攻陷广昌、南丰、新城、泸溪等地，又流窜至贵溪县境内。建昌府官军分兵围剿，但匪寇行动飘忽，难以遏制。
八月初一，大批敌军增援瑞州，城内的敌军也出城袭击军营，官军迎战并将其击退。初四日，瑞州官军进攻敌军堡垒，成功攻破，敌军溃逃。至此，湖北军和江西军的营垒才真正稳固下来。
八月初七，曾国藩紧急上奏，报告湖北援军进攻瑞州府城，江西派兵四千前往会合，接连取得胜利，江西与湖北之间的通道逐渐打通，整个战局出现转机，关键就在于此。奏折中保举知县刘腾鸿智勇双全为全军之冠，参将普承尧、同知吴坤修战功卓着，请求朝廷予以嘉奖。曾国华是臣的胞弟，不敢请求奖赏。又奏报刘于浔率领水师在瑞河口、临河口取得胜利，彭玉麟水师在南康获胜。随奏折保举刘于浔，请求赏赐花翎。
又上奏汇报进攻抚州获胜的奏折，并附片奏请朝廷命令山西、陕西两省每月各筹措白银三万两，调拨至江西瑞州等地，专供湖北、湖南援军使用。另奏报虎字营哨长周万胜私自逃回原籍，请旨饬令湖南巡抚严拿正法。同时奏报已遵照谕旨发函催促广东提督昆寿速赴江南大营。并陈述：江西敌军势力庞大，党羽众多，目前官兵兵力不可谓不雄厚，作战不可谓不艰苦，却至今未能收复重要郡县，扭转整个战局。
臣唯有坚持镇定，力求将大事化小，以安定军民之心。又上奏折报告赣州府城解除戒严，并陈述防守与剿匪情况，这确实是江西全局出现转机的重要表现。同时奏请查明吉安府阵亡及殉难的文武官员，请求朝廷从优抚恤。另附奏瑞州获胜战况的附片。
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