初三日，审核确定骑兵营的编制条例及步骑协同作战章程。
十五日，捻军攻破辛家寨，徐州进入戒严状态。
十九日，紧急上奏：接到朝廷谕旨，命李鸿章亲自率领杨鼎勋等部火速前往河南、洛阳一带，剿灭豫西的捻军，同时兼顾山西、陕西的门户防务。朝廷拟任命吴棠暂代两江总督，李宗羲、丁日昌依次代理漕运总督和江苏巡抚，并命臣迅速商议后回复。又接到谕旨，令鲍超率军赶赴河南，归臣统一调遣。
近日捻军向东逼近，距离徐州城不远，我军正全力防守东路，已调派郭松林、杨鼎勋两部在沂州、海州一带布防剿敌。若李鸿章前往河南、洛阳督师，则无其他兵力可调往西路。近来听闻福建、广东官军战果显着，太平军势衰，若改派鲍超前往河南，对河南战局将大有裨益。
至于李宗羲、丁日昌暂代封疆大吏之职，恐怕提拔过于仓促。近年来皇上求贤若渴，对地方大员保举的人才往往破格提拔，外界误以为这些官员都是非凡之才，便以严苛标准要求他们。于是御史们纷纷弹劾，连当初保举他们的大臣也受到牵连。
若让官员按资历逐步晋升，稍作历练，则被提拔者不会招致同僚嫉妒，言官也不会对封疆大吏产生敌意，这实在有利于朝野同心。况且朝廷的升降赏罚，本就不是外臣应当干预的。如今将督抚要职的任命，谕令臣等反复商议，更觉不妥，因此不等与李鸿章、吴棠商定，便直接陈述己见。
另附奏片报告：捻军有向南移动的迹象，传闻可能回窜雉河老巢，张总愚部已逼近湖北边境。此时陕西巡抚刘蓉因御史陈廷经弹劾，奏疏言辞激烈，受到朝廷严厉惩处。
本月，张总愚部流窜至湖北境内，随后又回窜河南。
福建官军攻克广东镇平县，贼军退守嘉应州城。左宗棠奉旨统领广东、江西各军，率部出境督战，三省官军合围嘉应州。鲍超新招募的湘勇一军赶赴江西、广东协同围剿。
十月初九日，检阅李昭庆所部马队、步队，下令加紧训练，使其成为一支可机动作战的精锐部队。
十一日，紧急上奏：徐州官军击败贼军获胜，但贼军仍流窜山东，潘鼎新在丰县击溃贼军后回驻济宁。另附奏片称：贼军之所以重视山东，是因运河东岸地势平坦、物产丰饶，不像河南那样荒凉贫瘠。臣之所以重视东路，是因山东北接京畿重地，关系天下根本；南连江苏，是湘军、淮军的根基所在。霜降后河水退落、河面结冰，河防更加紧迫，请朝廷下旨令直隶总督加强冬春防务，只可增兵，绝不能削减守备。若贼军回窜开封以西，将调遣主力游击部队赴河南会剿。另附奏片请求恢复吉林协领春寿、营总穆隆阿的原职。又奏请将四川训导唐焕章留营任用。
此时，张总愚率领的匪军从陕县、禹州向东流窜至开封境内，任柱、牛洪、赖文光等部则从曹州向西流窜，与张总愚会合，侵扰襄城、舞阳一带，其势正向湖北境内蔓延。
三十日，紧急上奏：捻军向西流窜，周盛波在宁陵击败贼军获胜，刘铭传在扶沟击败贼军获胜。目前贼军意图侵扰湖北，已下令徐州马步各军分驻周家口，腾出刘铭传一军作为机动部队，不再拘泥于十三府州的限制，随贼军动向跟踪追剿。李昭庆所率万人，待鞍马齐备后，立即调往河南进行灵活追剿。另附奏片：遣返吉林、黑龙江、察哈尔应撤官兵九百人，已启程回旗，参领三栋阿等病故请予抚恤。又奏：邸军办捐委员、前广东按察使龄椿病故请予抚恤。另附片奏：预先筹划鲍超一军进军路线，应以襄阳为基地，由湖北粮台负责供应银米军火。
本月，曾国藩研读《左传》，将书中记载的事件分类整理记录。
十一月初七日，开始审核长江水师永久章程及营制营规等文件，经过二十天的详细审核后完成定稿。
在徐州、铜山、沛县交界处，有一片因微山湖干涸而露出的土地。咸丰四五年间，山东曹州的百姓因黄河泛滥，为避水患南迁至此，后来迁居者越来越多，达到数万人，开垦的田地也逐渐扩大。当地官府按亩征税充作军饷，称这些移民为“湖团”，他们与沛县本地居民多次发生争讼械斗事件。捻军向东流窜时，曾与湖团暗中勾结，沛县百姓到曾国藩大营控告此事。曾国藩下令严查勾结捻军的湖团民众，审讯清楚后依法惩处，并派官员前往山东调查湖团民众的原籍，设法资助他们返回原籍。
二十七日，紧急上奏称：捻匪全部向西逃窜，原本计划进驻周家口，但因李昭庆所率部队的马匹装备尚未配齐，未能立即前进。又因铜山、沛县湖团一案与剿捻事务关系重大，待妥善安置处理完毕后，将立即赶赴河南督战剿匪。同时奏报广东贼势仍然猖獗，数万悍匪攻陷嘉应州，鲍超已从赣州出兵进剿，暂时难以调往河南。另上奏折禀明徽州闹饷一案审讯结果，分别作出判决，并将涉案两军十七营全部遣散回原籍。附片奏请对已故前皖南道张凤翥予以抚恤，以及已故水师营官提省成发翔予以抚恤。
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