这个月，捻军在河南集结后分兵行动。张总愚、牛洪率部西窜，被刘松山、张诗日部截击击溃；任柱、赖文光率部东窜，遭潘鼎新部迎击退却。
曾国藩之弟曾国荃调遣郭松林、彭毓橘等部驻守德安、随州。
鲍超所率部队此时已抵达湖北蕲州、黄州一带。
七月初四日，曾国藩紧急上奏汇报运河堤岸巡查情况：任柱、赖文光部捻军已回窜东路，先前奏请扼守沙河的策略难以立即实施，现命刘铭传、周盛波、潘鼎新率军赶赴东路追剿。但淮河南北遭遇数十年来罕见的大水，臣既因军务毫无进展而深感愧疚，又担忧灾民流离失所，可能被迫投靠贼寇求生，导致剿抚两难，实在忧心如焚！
初六日，从宿迁启航，停泊于杨庄。
初七日，吴棠前来舟中拜见。此时高邮州清水潭二闸处的运河堤岸决口，洪水淹没兴化、东台、盐城等县境。
初八日，换乘船只进入淮河。
初十日，渡过洪泽湖，停泊于盱眙。
十五日，船行至王家圩时遭遇狂风，船只险些倾覆，水师舢板船沉没八艘，官兵溺亡五人。曾国藩自述生平三次经历江湖风浪之险：道光十八年秋在襄河遇险；咸丰四年三月在岳州水军遇险；加上此次共历三次。
十六日，抵达临淮，登岸驻扎营中。
二十二日，巡视检阅张锡嵘所部淮勇营。
二十三日，曾国藩因暑湿致病，服药调养数日后痊愈。自此之后，每逢患病，他常坚持不服药的主张，可见其面对生死之际，已能超脱淡然。
二十八日，曾国藩紧急上奏：潘鼎新部迎击捻军获胜，任柱、赖文光部已逃窜至贾鲁河以西，仍计划扼守贾鲁河、沙河防线，阻止其回窜。另附奏片报告：船队遭遇大风，随行知县谭鳌因船只倾覆遇难，请求抚恤。又附片奏报刘松山、张诗日两军在西华、上蔡等地取得大捷，并自述途中患病情况，仍坚持带病西进。上奏后登船继续行程，停泊于怀远县。
三十日，船泊蒙城县。本月，官文上奏请求任命曾国藩之弟曾国荃为军务帮办。
张宗禹、牛洪所部西窜至南阳，刘松山会同河南官军宋庆等部追击至新野、邓州、南召、鲁山一带。任柱、赖文光部流窜至襄城以南。
八月初一日，曾国藩在蒙城换乘小船逆涡河上行，派遣亲兵由陆路先行赶赴周家口，并命令辎重船队改道逆淮河上行至颍河，再转赴周口。
初二日，船停雉河集。初四日，抵达亳州。
初六日，从亳州登岸启程。
初八日，行至陈州府，前往袁端敏公祠祭拜。
初九日，到达周家口军营。
十二日，曾国藩紧急上奏，详细报告刘松山、张诗日剿灭捻军的胜仗。奏折中称：近年来捻匪猖獗，从未遭受如此重创，此次湘军奋勇作战，使捻军气焰大减，待查明详情后将统一奏请嘉奖。另附奏片称：自己病情未愈，请求准假一月，在军营中调养治疗。
另附奏片称：任柱、赖文光部长期盘踞在舞阳与叶县交界处，有向东北回窜的迹象；张宗禹、牛洪部也传闻准备回窜。现正调派各军堵截围剿。鲍超部将从汝宁向北出击迎战，全力扼守捻军东窜之路；刘铭传等部继续修筑堤墙工事，分段防守，以贯彻原定作战计划。
另附奏片称：臣向来办理保举事宜极为谨慎。攻克金陵后，曾陆续呈报六批保举名单，多次接到兵部驳回的咨文，要求核实考语重新申报。臣本应遵照部议办理，但因原保举名单中各统领分散在各省，核查十分困难。恳请皇上体恤将士立功之艰辛，敕令兵部准许按照原奏清单注册，以此激励将士奋勇立功。
刘铭传等部修筑的贾鲁河防御工事已经竣工。李鹤年调派六营官军在朱仙镇以北挖掘壕沟布防，淮军也分兵协助。但因河沙淤积严重，疏浚工作进展困难。此时捻军主力从许州向北流窜。十六日，捻军逼近开封府，全军冲破壕沟防线向东逃窜，迅速向山东方向进犯。
二十三日，曾国藩紧急上奏，报告捻军东窜，河防未能奏效，已调派刘铭传、潘鼎新等部赴山东追击围剿。另附奏片称：剿捻一年多仍无成效，深感忧虑惭愧；请求圣旨命令李鸿章携带两江总督印信驻守徐州，与山东巡抚共同办理东路军务；湖北巡抚曾国荃携带印信移驻南阳，与河南巡抚共同办理西路军务；臣现驻周家口，地处数省中心，便于联络各方，互通军情。
另附奏片称：当初决定防守沙河、贾鲁河，本就是最笨拙的策略，只因流寇难以制服，不得已才出此下策。此次捻军东窜，是从河南防区突破，或许会有人归咎于巡抚李鹤年。臣谨详细陈述公允之见，恳请皇上暂免追究责任，以便大家同心协力，为将来共同设防谋划。
另附奏片请求调派浙江处州镇总兵马得顺率领所部骑兵赴河南协助剿捻。同日又上奏折称：捻匪以蒙城、亳州老巢为据点，当地刁民暗中勾结，平时伪装为民，出则为捻。其行径如同商贩远行般自然，竟无人觉得异常。
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