引据古今经史百家书目
李时珍说：自陶弘景、唐代、宋代以来所引用的，共有一百五十一家。我所引用的，除旧本之外，共有四百四十家。
《周易注疏》
作者：魏·王弼、晋·韩康伯注，唐·孔颖达疏
《本草纲目》引用：散见各卷（如卷一“序例”引《易》论阴阳）。
《毛诗注疏》
作者：汉·毛亨（毛苌传）、唐·孔颖达疏
《本草纲目》引用：多引动植物名（如卷十五“艾”引《诗》注）。
《尔雅注疏》
作者：晋·郭璞注，宋·邢昺疏（李巡为东汉注家，已佚）
《本草纲目》引用：卷十四“薄荷”引《尔雅》释草名。
《尚书注疏》
作者：旧题汉·孔安国传（实为伪托），唐·孔颖达疏
《本草纲目》引用：卷三十七“茯苓”引《尚书·禹贡》。
《春秋左传注疏》
作者：晋·杜预注，唐·孔颖达疏
《本草纲目》引用：卷二十六“姜”引《左传》典故。
《孔子家语》
作者：旧题三国·王肃注（托名孔子）
《本草纲目》引用：卷三十九“蜂蜜”引《家语》论养生。
《礼记注疏》
作者：汉·郑玄注，唐·孔颖达疏
《本草纲目》引用：卷二十五“酒”引《礼记》制酒法。
《周礼注疏》
作者：汉·郑玄注，唐·贾公彦疏
《本草纲目》引用：卷十五“芍药”引《周礼》药用记载。
《列子注》
作者：东晋·张湛注（原书托名列御寇）
《本草纲目》引用：卷五十二“人部”引《列子》论养生。
《庄子注》
作者：晋·郭象注（原书庄周）
《本草纲目》引用：卷三十七“柏实”引《庄子》寓言。
《荀子注》
作者：唐·杨倞注（原书荀况）
《本草纲目》引用：卷六“水部”引《荀子》论自然。
《淮南鸿烈解》
作者：汉·刘安编，高诱注
《本草纲目》引用：卷七“丹砂”引《淮南子》炼丹说。
《吕氏春秋》
作者：秦·吕不韦编，汉·高诱注
《本草纲目》引用：卷二十三“麦”引《吕览》农时记载。
《抱朴子》
作者：晋·葛洪
《本草纲目》引用：卷九“金银”引《抱朴子》炼丹术。
《战国策》
作者：汉·刘向编订
《本草纲目》引用：卷三十八“弓弩”引策中典故。
《史记》
作者：汉·司马迁
《本草纲目》引用：卷四十八“鸡”引《史记·货殖列传》。
《汉书》
作者：汉·班固
《本草纲目》引用：卷十五“薏苡”引《汉书·马援传》。
《后汉书》
作者：南朝宋·范晔
《本草纲目》引用：卷五十“牛”引《后汉书》民俗。
《三国志》
作者：晋·陈寿
《本草纲目》引用：卷三十六“枸杞”引《三国志·吴书》。
《晋书》
作者：唐·房玄龄等（王隐《晋书》为私修，已佚）
《本草纲目》引用：卷四十七“鹤”引《晋书》轶事。
《宋书》
作者：南朝梁·沈约
《本草纲目》引用：卷三十七“五加皮”引《宋书》药效。
《梁史》
作者：疑为唐·姚思廉《梁书》（萧显明无考）
《本草纲目》引用：未明确标注。
《北史》
作者：唐·李延寿
《本草纲目》引用：卷三十四“胡椒”引《北史》西域传。
《隋书》
作者：唐·魏征等
《本草纲目》引用：卷十四“迷迭香”引《隋书》贡品。
《唐书》
作者：宋·欧阳修等《新唐书》
《本草纲目》引用：卷二十六“蒜”引《唐书》食疗方。
《轩辕本纪》
作者：唐·王瓘（托名黄帝）
《本草纲目》引用：卷一“序例”引黄帝制药传说。
《穆天子传》
作者：晋·郭璞注（原书作者不详，传为战国时人）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《秦穆公传》
作者：不详（疑为后世伪托）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《蜀王本纪》
作者：汉·扬雄
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《鲁定公传》
作者：不详
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《汉武故事》
作者：旧题汉·班固（一说南朝王俭）
《本草纲目》引用：卷五十一“鼠”部引汉武帝射鼠事。
《汉武内传》
作者：旧题汉·班固（实为六朝人伪托）
《本草纲目》引用：卷九“芝”类引西王母赐武帝灵芝事。
《壶居士传》
作者：不详（疑为道教典籍）
《本草纲目》引用：未查得明确引用。
《崔魏公传》
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