标本阴阳
李杲说：治病应当懂得分辨标本。就身体而言，外在为标，内在为本；阳气为标，阴气为本。
六腑属阳为标，五脏属阴为本；脏腑在内为本，十二经络在外为标。而脏腑、阴阳、气血、经络又各有其标本关系。以疾病而言，先受病邪为本，后传变为标。因此治疗百病必先治其本，后治其标。若不如此，邪气会愈发猖獗，病情将更加深重。即使先发为轻症后发为重病，也应先治轻症后治重症，如此邪气方能被制伏。若出现中满或大小便不通之症，则不论标本先后，必先治胀满及二便问题，因其属危急之症。所以说：病情缓和时治其本，危急时治其标。此外，从相生之脏传来的病邪为实邪，从相克之脏传来的为虚邪。实邪当泻其所生之子脏，虚邪当补其生我之母脏。例如肝受心火所传（心为肝之子），此为实邪，应先刺肝经荥穴泻心火以治本，后刺心经荥穴泻心火以治标。用药时以入肝经之药为引，泻心火之药为君药。医经所言“本而标之”，即先治本后治标之理。又如肝受肾水所乘（肾为肝之母），此为虚邪，应先刺肾经井穴补肝木以治标，后刺肝经合穴泻肾水以治本。用药时以入肾经之药为引，补肝之药为君药。医经所言“标而本之”，即先治标后治本之法。
升降浮沉
李杲说：药物有升、降、浮、沉、化五种作用趋势，以及生、长、收、藏、成五种功效，与四季相配。春季主升，夏季主浮，秋季主收，冬季主藏，土居中央主化。因此，药味淡薄的，能升发而生；药气淡薄的，能沉降而收；药气浓厚的，能外浮而长；药味浓厚的，能内沉而藏；气味平和的，能运化而成。凡是用辛、甘、温、热及气味淡薄的药物补益，便是助长春夏的升浮之气，同时也就削弱了秋冬的收藏之性，对应人体就是肝心二脏。凡是用酸、苦、咸、寒及气味浓厚的药物补益，便是助长秋冬的降沉之气，同时也就削弱了春夏的生长之性，对应人体就是肺肾二脏。淡味药物，能渗利则为升，能泄下则为降，主要起辅助和引导其他药性的作用。医者用药遵循此理则生机可续，违背此理则危殆难免；即便不死，也会陷入重病困顿之境。
王好古说：要使升浮的药性转为沉降，必须懂得抑制的方法；要使沉降的药性转为升浮，必须懂得承载的方法。辛味能发散，但其作用趋向横向；甘味能宣发，但其作用趋向上升；苦味能泄降，但其作用趋向下行；酸味能收敛，其性质收缩；咸味能软化，其性质舒缓，它们的特性差异如此明显。拍手能成声，浇水能沸腾，两种物质相互作用，其中自有规律。五味相互制约，四气彼此调和，这种变化岂能轻易对待？本草书籍未提及淡味与凉气，也是内容的缺失。
药性轻薄的具有升发作用：如甘平、辛平、辛微温、微苦平的药物。
药气轻薄的具有沉降作用：如甘寒、甘凉、甘淡寒凉、酸温、酸平、咸平的药物。
药气浓厚的具有升浮作用：如甘热、辛热的药物。
药味浓厚的具有沉降作用：如苦寒、咸寒的药物。
气味平和的药物兼具升降浮沉之性：如甘平、甘温、甘凉、甘辛平、甘微苦平的药物。
李时珍说：酸味和咸味的药性不会上升，甘味和辛味的药性不会下降，寒性药物不会外浮，热性药物不会内沉，这是它们固有的性质。但若用咸寒药物引导本应上升的药性，就能使其下沉直达下焦；用酒来引导本应下沉的药性，则可使其上浮直至头顶。若非洞悉天地奥秘、通晓自然规律之人，无法领悟这般道理。
同一种药物中，根部药性上升而梢部下降，生用时升发而熟制后沉降，可见药性的升降既取决于药物本身，也取决于人的运用方法。
四时用药例
李时珍说：《内经》指出，必须首先顺应岁气，不可违逆自然规律。又说：对升降浮沉的气机应当顺从，对寒热温凉的属性则要反向调节。因此春季宜添加辛温类药物如薄荷、荆芥，以顺应春升之气；夏季宜用辛热类药物如香薷、生姜，以顺应夏浮之气；长夏时节宜加甘苦辛温之药如人参、白术、苍术、黄柏，以顺应土气化育之功；秋季宜用酸温类药物如芍药、乌梅，以顺应秋降之气；冬季宜加苦寒类药物如黄芩、知母，以顺应冬沉之气，这就是顺应时令以养护天和的道理。《内经》还强调：春季减酸增甘以养脾，夏季减苦增辛以养肺，长夏减甘增咸以养肾，秋季减辛增酸以养肝，冬季减咸增苦以养心。如此既能不违天和，又可防止过偏，体现了顺应天地化育的至理。愚昧者舍本逐末，春季用辛凉药克伐肝木，夏季用咸寒药抑制心火，秋季用苦温药泄肺金，冬季用辛热药耗竭肾水，还称之为应时之药。这完全违背了《素问》逆顺调和的原理，从夏季阴气内伏、冬季阳气内藏的规律便可推知。虽然一年分四季，一日也有四时变化，或出现春见秋病、夏得冬症的情况，医者需灵活掌握，随机应变，不可拘泥一端。王好古认为：四季均可将芍药作为脾经引药，苍术为胃经引药，柴胡为时令引药，因十一脏功能皆取决于少阳，此为生发之根本。凡用纯寒、纯热或寒热相杂之药，都应以甘草调和，唯中满证候禁用甘味。
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