广成子与林玄相继离去，犹如为轩辕与蚩尤卸下了最后的保护伞，也彻底将他们推上了人族这艘巨舟的舵手之位。黄帝轩辕与兵主蚩尤，这对因战而和、因道而合的君臣，真正开始了他们携手并治人族的新篇章。
没有了圣人与大能在背后直接指点，所有压力与决策，都落在了他们自己肩上。然而，这对黄金搭档展现出了惊人的默契与能力。
轩辕坐镇涿鹿，以仁德为基，以智慧为引，勤政不辍。他每日于明堂听政，与风后、力牧、大鸿、常先等文臣武将商议国是，处理来自四面八方的政务。推广农耕新法，兴修水利沟渠，制定历法节气，统一度量衡，规范文字，制定礼仪制度，鼓励工匠百艺……一桩桩，一件件，千头万绪，却在他的主持下，有条不紊地铺展开来。
他深知，真正的统一，非仅止于名义上的臣服，更在于人心的归附与文化的融合。因此，他大力推行教化，设立“庠序”（早期学校雏形），选拔聪慧子弟，传授文字、历法、礼仪、算学、医术等知识。又命伶伦制定礼乐，以乐和民心，以礼定尊卑。对于归附的诸部，尤其是原九黎联盟的各部，轩辕给予充分尊重，保留其部分习俗与传统，同时逐步推行统一政令，选拔其部族中贤能之人，进入中央任职。蚩尤在此过程中起到了关键作用，以其在九黎的崇高威望，说服各部，化解矛盾，使得融合进程远比预想的顺利。
蚩尤则主外，执掌兵戈。他并未因“兵主”之位而懈怠，反而更加勤勉。在轩辕支持下，他对人族军队进行了大刀阔斧的改革。融合有熊与九黎的军事长处，建立了一套更为完善、高效的军事体系。
首先，确立“王师”为核心常备军，由最忠诚、最勇猛的战士组成，装备最精良的青铜兵甲，由蚩尤亲自选拔将领，严格训练，传授战阵搏杀之术。这支“王师”驻扎涿鹿及几处要害之地，是王朝最精锐的武力保障。
其次，推行“兵民合一”的普遍兵役制。规定各部落青壮，农闲时必须接受军事训练，由“王师”派出的教官负责。同时，划定“戍区”，各部落需轮流派出青壮，前往边境或要地戍守。此举既保证了充足的兵源，又不至于过度影响生产，更将军事训练与保家卫国的意识推广至全民。
再者，设立专门的“军器监”，统一管理青铜矿的开采、冶炼与兵器甲胄的铸造。蚩尤将九黎部先进的青铜技术毫无保留地贡献出来，制定了严格的兵器制式与质量标准，使得人族军队的装备水平得到了质的飞跃。从粗糙的石器、骨器、木器，迅速向标准化、制式化的青铜兵器过渡。
此外，蚩尤还主持修订了军法，明确了赏罚条例，强调军纪。他治军极严，但赏罚分明，且能与士卒同甘共苦，深得军心。在蚩尤的整顿下，人族军队脱胎换骨，从过去松散、装备落后的部落武装，迅速向一支纪律严明、训练有素、装备精良的正规军转变。
有了蚩尤这把锋利的“兵戈”在手，轩辕推行内政改革、德化四方，便有了最坚实的保障。那些原本还对新兴的黄帝王朝心存疑虑、阳奉阴违，甚至暗中觊觎的部落、方国、乃至一些周边异族势力，在“王师”赫赫兵威的震慑下，纷纷收敛心思，遣使朝贡，表示臣服。偶尔有不长眼的刺头，试图挑战新秩序，也很快在“王师”的铁蹄下灰飞烟灭。蚩尤用兵，既有堂堂正正之师，也有奇正相合之谋，更兼自身勇武绝伦，往往身先士卒，所向披靡。“兵主”之名，随着一次次胜利，迅速传遍四方，成为威权的象征，却也因其治军严明、不妄杀、不扰民，赢得了“义战”之名。
对内，轩辕仁政如春风化雨，蚩尤兵威如定海神针；对外，轩辕怀柔德化，蚩尤征讨不臣。二人配合无间，一柔一刚，一张一弛，迅速稳定了人族内部，并开始将影响力向外辐射。
在轩辕与蚩尤的共同努力下，短短数十年间，黄帝王朝的疆域与影响力不断扩大。东至大海，西抵流沙，南至交趾（泛指南方炎热之地），北逐荤粥（北方游牧部落泛称），诸多部落、方国纷纷归附。人族的活动范围，文明的影响区域，达到了前所未有的广度。原本分散的、松散的部落联盟形态，开始向一个初具雏形的、中央集权的王朝过渡。
涿鹿城，作为王朝都城，也迎来了翻天覆地的变化。城池规模不断扩大，城墙高厚，街道纵横，宫室巍峨。来自四面八方的人才、货物汇聚于此。有熊氏精巧的陶器、丝帛，九黎部锋利的青铜器，东夷的珍珠美玉，南方的珍稀木材，北地的皮毛良马……在这里交易流通。不同口音、不同服饰的人们在这里和睦相处，交易货物，交流技艺，传播见闻。一种前所未有的、包容并蓄的繁荣景象，在这座新兴的都城中呈现。
文明的火种，在统一的政权推动下，以前所未有的速度传播、交融、升华。文字的使用范围扩大，历法得到推广，农耕技术改进，手工业分工细化，医学知识积累，礼乐制度初步建立……一个以黄帝为共主，以涿鹿为中心，以仁德与武力共同维护的、幅员辽阔的人族王朝，已然屹立于洪荒东方，其蒸蒸日上的气象，其蓬勃凝聚的人道气运，令诸天仙神侧目。
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