随着暗影主宰的倒下，联盟舰队以为终于可以松一口气，然而，他们却未曾察觉到一股更为隐秘而危险的力量正在暗处悄然滋生。
在“暗影秩序”舰队的残骸之中，一些被黑暗力量侵蚀至深的机械核心开始自我重组，它们融合了战场上残留的各种先进科技与邪恶能量，逐渐形成了一群拥有自主意识的黑暗机械傀儡。这些傀儡身形巨大，周身散发着幽冷的黑芒，它们的双眼闪烁着仇恨与毁灭的红光，仿佛要将联盟舰队彻底撕碎以报覆灭之仇。
这些黑暗机械傀儡迅速对联盟舰队展开了疯狂的报复性攻击。它们的攻击毫无规律却又异常凶猛，每一次机械臂的挥动都携带着强大的能量冲击，能够轻易地撕裂战舰的外壳，如同切入豆腐一般。联盟舰队的士兵们刚刚经历了与暗影主宰的生死搏斗，早已疲惫不堪，但此刻他们只能强打起精神，再次投入到这场突如其来的战斗中。
“星耀号”的舰桥内，林宇望着窗外如潮水般涌来的黑暗机械傀儡，眼神中透露出前所未有的凝重。他深知，这是“暗影秩序”最后的疯狂，也是对联盟舰队意志的终极考验。“所有战舰，集中火力，优先攻击那些靠近核心能源系统的傀儡！”林宇下达了紧急命令，声音中带着一丝疲惫却依旧坚定。
凯伦拖着受伤的身躯从医疗舱中冲了出来，他不顾医生的阻拦，重新穿上那套破损的“光明圣铠”，拿起“星辰之剑”，再次冲向了战场。“我不能让战友们独自面对危险，只要我还有一口气在！”他心中怒吼着，眼中布满血丝，那是战斗的狂热与对胜利的执着。
艾娃带领着精神念力者们也重新集结起来，尽管他们的精神力量已经极度透支，但依然强撑着虚弱的身体，试图用精神力干扰黑暗机械傀儡的行动。然而，这些傀儡似乎对精神力攻击有了一定的抗性，艾娃等人的努力只能暂时减缓它们的攻击速度，却无法完全阻止它们的前进。
在战场上，一艘艘联盟战舰在黑暗机械傀儡的猛烈攻击下相继起火爆炸。“曙光号”的舰长在战舰即将被摧毁的瞬间，下达了全员弃船的命令，自己却毅然决然地留在了指挥台上，驾驶着“曙光号”朝着一群黑暗机械傀儡冲了过去。“为了联盟，为了和平，同归于尽吧！”他怒吼着，战舰在巨大的碰撞中化作一团耀眼的火球，与敌人同归于尽。
地球的陆军部队在陆地上也遭遇了黑暗机械傀儡的袭击。汤姆带领着剩余的机械师和士兵们，利用战场上的残骸和地形，临时构建起一道道防御工事。他们手中的武器不断地向敌人开火，但面对傀儡强大的防御和攻击力，他们的攻击显得有些力不从心。
李博士在临时医疗站内忙碌地救治着伤员，他的双手不停地颤抖着，不是因为恐惧，而是因为过度的劳累和对战友们伤亡的痛心。“为什么战争还不肯停止？我们已经付出了太多！”他喃喃自语着，眼中闪烁着泪光，但手中的动作却没有丝毫懈怠。
林宇看到一艘艘战舰的覆灭和战友们的牺牲，心中的怒火被彻底点燃。“不能再这样下去了，我们必须主动出击，找到这些傀儡的核心控制源，彻底摧毁它们！”他做出了一个大胆的决定，亲自率领一支由最精锐战士组成的敢死队，乘坐着小型突击舰，朝着黑暗机械傀儡群的深处冲了过去。
敢死队在突击舰上，紧张地准备着即将到来的战斗。他们知道，这一去可能就再也回不来了，但他们没有丝毫犹豫，因为他们的身后是整个联盟，是无数文明的和平与希望。当突击舰冲入傀儡群中时，他们遭遇了敌人最为猛烈的攻击。林宇操控着突击舰的防御系统，为队员们争取着时间。“大家准备好，一旦找到机会，就立刻冲向目标！”他大声喊道。
凯伦率先冲出了突击舰，他挥舞着星辰之剑，如同一道流星般划过黑暗的战场，朝着一个看起来像是核心控制源的巨大傀儡冲了过去。其他队员们也纷纷跟上，他们用生命在黑暗机械傀儡的包围中开辟出了一条血路。
在激烈的战斗中，凯伦终于接近了那个核心控制源傀儡。他高高举起星辰之剑，汇聚起全身的力量，朝着傀儡的核心部位刺了下去。就在剑即将刺入的瞬间，傀儡突然释放出一道强大的能量护盾，将凯伦震飞了出去。
“不，我不能失败！”凯伦挣扎着爬了起来，再次冲向傀儡。这一次，他与傀儡展开了一场惊心动魄的近身搏斗。星辰之剑与傀儡的机械臂相互碰撞，溅起无数的火花。凯伦凭借着顽强的意志和出色的战斗技巧，终于找到了傀儡的一个破绽，他毫不犹豫地将星辰之剑刺入了傀儡的核心。
随着核心控制源傀儡的瘫痪，其他黑暗机械傀儡的行动瞬间变得迟缓起来。联盟舰队抓住这个机会，集中所有剩余的火力，对这些傀儡进行了最后的清扫。在一片硝烟弥漫的战场上，联盟舰队终于彻底击败了“暗影秩序”的残余力量。
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