此后，在华佗的精心调理下，陈登的病情逐渐好转，身体也慢慢恢复了健康。
陈登对华佗感激涕零，称赞华佗为“再生父母”，并感叹道：“若不是先生妙手，我这条命怕是要葬送在这怪病上了。先生的大恩大德，我没齿难忘。日后若有需要我陈登的地方，先生尽管开口。”
华佗的声名如日中天，甚至传到了曹操的耳中。曹操长期饱受头风病的折磨，发作时头痛欲裂，仿佛有千万根针在脑袋里乱刺，苦不堪言。听闻华佗的医术高超，曹操便召他前来为自己治病。
华佗来到曹操营帐后，仔细为曹操诊断病情。他认真地观察曹操的面色、神情，聆听曹操对病情的描述，然后为曹操把了脉。
经过一番望闻问切，华佗对曹操说：“丞相之病，由来已久，病根颇深，非一朝一夕可治愈。需长期调理，方能缓解症状。我会为丞相制定一套详细的治疗方案，包括药物治疗和日常调养。药物方面，我会根据您的病情变化适时调整药方；调养方面，您需注意休息，避免过度劳累，保持心情舒畅。”
曹操听后，心中不悦，怀疑华佗有意拖延，不肯尽心尽力为他治病。他皱着眉头，冷冷地说道：“你莫不是在故意夸大病情，拖延时间？我听闻你的医术高超，为何不能立即根治我的病？”
华佗赶忙解释道：“丞相，头风病本就难以根治，需慢慢调养。我所开的药方和调养之法，皆是为了丞相的身体着想。医学之道，讲究循序渐进，不可急于求成。还望丞相耐心配合治疗。”
曹操却不以为然，冷哼一声：“我看你是另有企图吧！若你真有本事，就应尽快治好我的病。”
华佗无奈地摇了摇头，深知曹操生性多疑，难以说服他。但他仍坚持自己的专业判断，说道：“丞相，治病并非儿戏，需遵循医学规律。我定当竭尽全力为丞相减轻痛苦，但还请丞相相信我的治疗方案。”
曹操虽心中不满，但此时头痛难忍，也只能暂且让华佗按方案治疗。
在华佗的精心医治下，曹操的头风病发作次数有所减少，疼痛程度也有所减轻。
然而，曹操生性猜忌，对华佗的疑虑并未消除。他心想，这华佗若能轻易治好我的病，却为何总说要长期调理，莫非是想借此拿捏我？
此时，华佗因久离家乡，思念亲人，便向曹操告假回乡。曹操心中虽有不悦，但还是准了假，不过限定了归期。
华佗回到家乡后，恰逢家中老母病重，他自是要悉心照料，因此未能按时返回。曹操多次派人催促，华佗皆因母亲病情未愈而无法成行。
曹操大怒，认为华佗有意违抗自己的命令，对他的怨恨愈发加深。他对手下说：“这华佗竟敢如此无视我的命令，莫非是不把我放在眼里？”于是，曹操下令将华佗抓回。
华佗被押回后，曹操怒目而视：“你为何屡次违背我的命令，拖延不归？”
华佗坦然道：“丞相，实因家母病重，为人子者，怎能不尽孝？我本想待母亲病情好转便即刻返回，还望丞相明察。”
曹操却不听解释，喝道：“你这分明是借口，莫非是想借此机会谋害于我？”
华佗心中悲愤，却仍试图解释：“丞相，我一心钻研医学，只为救天下苍生，怎会有此歹意？望丞相以天下为重，莫要错怪好人。”曹操却不为所动，执意将华佗下狱。
在狱中，华佗深知自己命不久矣，但他心中仍牵挂着自己一生所学的医学知识。他想，若这些知识就此失传，那将是天下苍生的损失。于是，他拖着疲惫的身体，日夜奋笔疾书，将自己一生的医学心得和临床经验着成《青囊书》。
书成之后，他找到狱卒，眼中满是期望与恳切，对狱卒说：“我一生行医，救人无数，这本《青囊书》是我毕生心血的结晶，记载了诸多治病救人的良方和医术，可救人无数。我深知你惧怕曹操，但求你念在天下百姓的份上，好生保存此书，莫要让它失传。”
狱卒面露难色，犹豫再三说道：“先生，我也敬佩您的医术和为人，可曹操生性多疑，手段狠辣，我若私藏此书，一旦被发现，便是死罪。我上有老下有小，实在不敢冒险啊。”
华佗心中悲痛万分，他看着手中的《青囊书》，泪水夺眶而出。他知道，自己一生的心血即将付诸东流，无数可能被拯救的生命也将失去希望。无奈之下，他忍痛将书焚毁。
狱卒见状，心中懊悔不已，慌乱中抢出几页，可惜所抢出的内容，仅仅是关于阉鸡猪之法。
华佗长叹一声：“罢了罢了，或许这就是天意。”不久后，华佗含冤而逝。
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