户部右侍郎方泽即刻起身解释：“赈粮早已运抵苏州府，然需礼部先确认受灾户数以定分发标准，臣部已多次行文礼部，至今尚未收到回复，故未敢贸然分发。”礼部尚书吴鼎闻听此言，当即躬身致歉：“臣部近期忙于修订《科举新则》，竟延误了受灾户数核查之事，臣罪该万死！臣已令下属官员星夜赶往江南，三日内必完成核查，提交详细名册。”
张伏依《细则》从容部署：“此次赈济事务，以礼部为主导，吴尚书全权负责统筹赈款赈物分发事宜，三日内完成户数核查并制定详细分发方案；户部方侍郎负责保障后续赈粮补给，确保供应不辍；工部需即刻派遣郎中江澈前往江南，牵头修缮堤坝，协同地方征调民力，加固防洪防线。浙江布政使秦仲负责地方对接，确保款物直达百姓手中，不被克扣截留。”
在联席会议的统筹调度之下，礼部官员仅用两日便完成受灾户数核查，赈粮顺利分发至百姓手中；江澈亦率工部匠人星夜赶赴江南，与秦仲密切配合，一月之内便完成重点堤坝修缮。江南百姓领到赈粮，又见稳固的堤坝已然筑起，怨声渐消，纷纷称颂新政惠民。六部联席会议制在民生领域的成功推广，有效破解了跨部门协同的顽疾，民心愈发凝聚。
联席会议制推行月余，虽成功解决诸多难题，却仍出现部分部门“会上应承如流、会后拖延塞责”之况。江南赈济后续漕运补给之中，户部虽已足额拨发粮款，却因漕运衙门配合不力致粮船延误，而漕运归属户部右侍郎方泽分管，方泽竟以“漕运衙门属地方管辖”为由推卸责任，置百姓饥寒于不顾。
萧燊得知此事后，怒不可遏，将漕运延误的奏报掷于御案之上，厉声对近侍道：“朕推行联席会议制，为的是打通梗阻、惠及百姓，不是让某些人拿‘权责’当推诿的挡箭牌！”当即令门下省侍中纪云舟牵头核查。纪云舟奉旨严查，很快查明真相：漕运衙门虽属地方建制，但其经费调拨与事务调度皆由户部统筹，方泽的推诿之举，实属履职不力、玩忽职守。萧燊随即召集专题联席会议，六部主官悉数到场，他手持核查结果，语气冰冷：“方泽身为户部右侍郎，分管漕运却遇事推诿，置江南百姓饥寒于不顾，此等履职不力之态，若不严惩，何以服众？何以推行新制？”当即下旨：“方泽罚俸半年，降职留用，即刻赶赴江南督办漕运补给，限期完成，若再有延误，严惩不贷！”随后，他转向众臣，当众严明诏令：“协同部门需对分管环节全程负责，纵涉及地方事务，亦不得推诿塞责。六部联席会议的核心是‘共担’，不是‘分责’，凡有违者，必从严追责！”萧燊的雷霆手段，让在场六部官员无不凛然，更深刻理解了协同机制的刚性要求。
为强化监督、杜绝此类乱象，纪云舟趁热打铁，沉声提议：“应建立‘决议跟踪台账’制度，由门下省专设官员负责记录每次会议决议、责任部门、完成时限，定期核查进度，每月将核查结果汇总上报陛下。对逾期未完成者，无需再经会议商议，直接提交都察院追责问罪。”
吏部尚书沈敬之亦补充建言，条理清晰：“可将联席会议履职情况纳入六部官员年度考核核心内容，与升迁奖惩直接挂钩。考核优秀者，优先提拔任用；履职不力者，取消年度考核资格；连续两年考核不合格者，调离现职，另行安置。”萧燊当即准允，即刻令吏部与门下省联合制定《联席会议履职考核办法》，速速推行。
《办法》实施之后，门下省每月提交的跟踪台账清晰列明各部门履职情况，都察院据此严肃查处了3名拖延履职的官员，或罚俸、或降职，震慑全场。六部官员履职意识显着增强，联席会议决议的落地效率大幅提升，政令通行愈发顺畅。
随着联席会议制日趋成熟，萧燊决意将其推广至重大工程统筹领域，西北烽火台扩建工程便成为首个重点议题。此次会议由中书令孟承绪协同内阁主持，兵部、户部、工部、吏部及西北地方军政官员代表悉数参会，共商边防建设大计。
大将军蒙傲率先出列奏报，声如洪钟：“西北乃国之屏障，需扩建烽火台五十座、加固堡寨二十座，方能形成完整防御体系，抵御鞑靼侵扰。此项工程需兵部统筹军事布局、工部负责施工营建、户部保障经费供给、吏部调配官员督办，涉及部门众多，需严密协同，方不误事。”
兵部尚书秦昭随即补充，条理清晰：“臣部已拟定烽火台布局方案，然需工部按军事防御标准设计施工图纸；西北副总兵赵烈忠勇善战，可牵头现场督导施工，确保工程符合防务需求，不存纰漏。”谢明亦上前奏道：“扩建工程需经费百万两，臣部已初步核算，可从盐课改革增收之中列支，只需工部提交详细预算，臣部便可即刻统筹拨款，保障经费充足。”
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