新政推行，乃大吴近年核心大事，亦是国史编纂的重点内容。林文昭令沈从之、苏晚卿协助史官，系统梳理新政推行的全过程，包括选贤令、盐铁改革、科举改革、民生工程等各项举措，总结战时与战后治理的经验教训。
沈从之熟悉吏治调整，重点梳理了选贤令推行的史料：已故太子太保、吏部尚书沈敬之，作为选贤令推行的核心主导者之一，历仕多朝，整肃吏治，选拔贤才，其功绩被详细记录；吏部左侍郎宋景初，协助审核京官考绩，剔除冗官；自己则侧重地方官铨选，推行“实绩优先”标准，这些举措皆被纳入国史，彰显新政吏治改革的成效。
苏晚卿秉持谢渊“以民为本”初心，重点整理新政民生举措：户部左侍郎王砚，主持盐课改革，厘清魏党遗留盐务旧账，推动盐课收入激增，为民生工程筑牢财力根基；工部右侍郎叶修远，督导各地兴修水利、推广高产粮种，助力农业增产；河南巡抚柳恒、苏州知府李董等地方官员，推行劝农桑、减赋税之策，造福一方百姓，这些民生实绩皆被详细记述。
礼部尚书吴鼎，令温庭玉、周文彬整理科举改革与教育新政的史料：修订《科举新则》，保障寒门士子应试公平；督导各地实学馆建设，推广经世致用之学；国子监祭酒孔学礼、司业韩子瑜，推行实学教育，培育经世致用之才，这些举措为大吴培养了大量贤才，被重点载入国史。
在整理新政史料过程中，史官们亦客观记录了新政推行中的困难与教训：魏党余孽暗中阻挠新政，侍中纪云舟驳回多份违规拟诏，保障新政顺利推进；部分地方官员初期对新政理解不足，推行不力，内阁阁老杨启令都察院佥都御史柳清臣巡视督查，督促整改；盐铁改革初期，部分盐商囤积居奇，谢明、王砚推行“三重核查制”，严堵漏洞，稳定盐价。
林文昭组织史局官员，对新政部分史料进行反复审核，强调：“记述新政，既要彰显成效，亦要正视不足，总结经验教训。如此，方能为后世治理提供借鉴，使后世君主知晓‘以民为本、选贤任能、革故鼎新’之重要性。”众人遵其言，反复打磨文稿，使新政部分成为国史中极具借鉴价值的篇章。
历经两年编撰，《大吴国史》初稿完成，共计五十卷，系统记录了大吴开国以来的历史进程，涵盖典章制度、战事军功、新政举措、吏治民生、名士传记等诸多方面。按照萧燊旨意，初稿需经内阁审核、礼部复核，再呈送圣驾审阅定稿，确保国史严谨无误、体例规范。
内阁首辅（时任阁老统筹）周伯衡，虽已辞官，却受萧燊之邀，参与国史审核。这位三朝元老，统筹朝政多年，熟悉开国以来的历史脉络，他带领内阁阁老杨启、张伏、杨璞、大学士李云岫，逐卷审核初稿。周伯衡重点审核典章制度与朝局变迁部分，对其中的时间、人物、事件逐一核实，确保准确无误。
杨启掌监察要务，重点审核国史中吏治监察与贪腐打击的内容，对都察院左都御史虞谦、右都御史梁昱，陕西按察使雷啸天等官员的监察事迹，以及查处的重大贪腐案件，逐一核对，确保记述客观公正；张伏专司地方实务，重点审核地方治理与民生工程部分，对江南治水、灾区赈济、地方赋税改革等内容，结合自己亲赴江南寻访贤才、主导民生工程的经历，提出修改意见；杨璞精研律法，重点审核国史中司法制度与律法修订的内容，对《大吴律》修订、重大冤案平反等事迹，予以细致核对。
礼部尚书吴鼎，带领礼部左侍郎温庭玉、右侍郎李默，对国史的体例规范、礼仪记述进行复核。吴鼎熟谙典章礼仪，对国史中郊祀、朝会、科举等大典的记述，以及礼乐制度的变迁，提出诸多修改建议；李默精通外交事务，重点审核对外交流部分的史料，对与东南亚、南洋诸国建立友好关系的过程，予以补充完善。
审核过程中，众人发现初稿中部分战事时间记载有误、部分新政举措的推行细节不够详实等问题，及时反馈给史局。林文昭带领史官，根据内阁与礼部的审核意见，逐一修改完善：萧文才核对兵部史料，修正战事时间；沈从之、苏晚卿补充新政推行细节；孔学文完善典章制度的记述。经过三个月的反复审核与修改，《大吴国史》审核稿完成，呈送萧燊审阅。
国史修撰，贵在严谨考据，宁缺毋滥。在编纂与修改过程中，林文昭始终强调“信史”原则，要求史官们对每一份史料、每一个细节，都要反复考据、核实，杜绝主观臆断、虚假记述，确保国史真实可信、经得起历史检验。
对于有争议的史料，史官们皆多方求证、严谨考据。在记述开国初期某场战事的领兵将领时，不同史料记载不一，萧文才即刻前往兵部，调取当年的军籍档案与战功册，又走访知情老将，最终核实领兵将领身份，修正史料谬误；在记述某地区赋税改革的成效时，李文博对照户部存档的赋税账目与地方官府的上报文书，同时走访当地百姓，确保数据真实、记述准确。
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