离开兰普奇市后，小智等人来到了一处小码头。由于错过了上一班通信船，三人只能等待三个小时后的第二班通信船前往少女峡在抵达黄金市
就在小智躺在地上，感到无聊时，皮卡丘一声声呼喊，吸引了三人的注意力，只见海面上一只墨海马浑身伤痕的望向了他们
“沓扣～沓扣～”（小霞，玛瑙水母和毒刺水母马上就要来了）
看着下面的墨海马，小霞心生怜悯的拿出了精灵球准备将它收服，但墨海马却在海面上喷出墨汁，形成了两只水母的图案
（我知道墨海马，放心吧，我们也会再次阻止他的，因为有小智在啊）小霞
知道接下来会发生什么的，小霞转头看向了一旁逗弄皮卡丘和拉鲁拉丝的小智，按一声巨响吸引了他们的注意力，只见海上的一艘船忽然起火发生了爆炸
“大事不好了，那艘船……”
“现在不是考虑这么多的时候，小智，派出水系宝可梦去把他们救回来吧，宝石海星，海星星，角金鱼拜托你们了”
“既然如此，呱头蛙，杰尼龟拜托你们了”
小智和小霞分别派出了自己的水系宝可梦去救回跳入海中避险的船员们，但被捞上岸的船员却浑身发麻的被抬上了救护车
只不过，在柜台上，救护车前，船员们却让小志三人前去通知他们的社长，在来到一处豪华的别墅后，见到的人却让小智，小霞和小刚为之一惊
“我就是这里的社长啊，婆婆，听说你们救了我的船员，婆婆，太感谢你们了，婆婆”
没错，面前的人与在兰普尔奇市遇到的金婆婆长得一模一样，随后，在婆婆的介绍下，三人也得知了眼前之人正是兰普尔奇市的金婆婆的表妹银婆婆
银婆婆的讲述下，小智，小霞和小刚也明白了发生了什么事情，由于银婆婆修建的海上餐厅影响到了玛瑙水母们的栖息地，因此遭到了玛瑙水母群和毒刺水母的进攻
而小霞虽然是第二次听到，但银婆婆说的那些诋毁水系宝可梦的话，却再一次点燃了对方的怒火
“你说令人讨厌！”
“恶心透顶了，也不能拿来吃，他们只能妨碍我赚钱啊，婆婆，你们几个我觉得就相当不错，还会用宝可梦来救人，这样吧，如果你们能帮我赶跑水母的话，一年之内最豪华的晚餐随你们享用，并且还有本金100万元啊，婆婆”
尽管银婆婆开出来的价格很诱人，但小智在小霞那准备吃人的目光下，并没有冲上前，而是跟着怒气冲冲的小霞离开了银婆婆的别墅
在离开后，小霞找到了受伤的墨海马，将其放在一个游泳池内与皮卡丘一起戏水玩耍，但是很快，城市中的广播响了起来，银婆婆以，100万元奖金为代价号召全城的人们去赶走玛瑙水母
随后，只见城市中的人们不断聚集在码头的港口，迎接着正在开着坦克的银婆婆。火箭队三人组也因为缺少资金去掺和这件事情，拿出了国产三杯醋，倒到了海中，使玛瑙水母发生了变异进化为了巨大毒刺水母
同时，在港口看着这一幕的小智手上的阿尔宙斯手环，也弹出了巨大毒刺水母的数据
【姓名：巨大毒刺水母
属性：水加毒
太晶属性：水
种类：水母宝可梦
性别：？？？
图鉴编号：073
性格：浮躁（不加不减）
特性：污泥浆
技能：？？？
携带道具：无
简介：愤怒的玛瑙水母受到了污染后聚合起来形成的巨大毒刺水母无法分离，
发布特殊性任务一次，解决玛瑙水母们聚合的问题，奖励mega进化石随机】
“受到污染源不能分离的巨型毒刺水母吗？而且还有个任务，应该是阿尔宙斯看到的这些事情，想让我替玛瑙水母们解决这些事情吗？不过就算没有任务，我也会尽力去拯救宝可梦们！”
看到下方数据显示出来的巨型毒刺水母的资料以及最后一行标注出来的一次性特殊任务，小智当即决定帮助玛瑙水母们解决这次的麻烦
但是就在小智想要冲上前阻止毒刺水母时，却被身后的小霞跟小刚拉着离开了这片地带，而由于巨型毒刺水母的关系，巨大的海浪席卷了整个城市，并且巨型毒刺水母还抓住了火箭队的喵喵充当翻译官
“我们是玛瑙水母跟毒刺水母，这次你们人类破坏了我们居住的地方，我们也要破坏你们的城市作为报复，任何人都没有资格来指责我们，让你们这些人类知道自己的家园被破坏的悲伤”
听到被控制的喵喵说出了玛瑙水母和毒刺水母的意思，小智当即忍受不了正脱开了小霞和小刚的束缚，拿出了自己的精灵球
“不可以这样毒刺水母，再这样下去的话，你们就跟银婆婆没什么区别了，大家一起帮吧！”
白光闪过后，呱头蛙，太古羽虫，比比鸟，妙蛙种子，杰尼龟，密勒顿，即在小智肩膀和头顶上的皮卡丘，伊布和拉鲁拉丝开始分头行动阻止毒刺水母和玛瑙水母的进攻
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