二十五日，曾国藩紧急上奏折报告：鲍超部攻克句容县，生擒两名太平军首领，摧毁五座敌军营垒。随折保举总兵冯标、谭胜达、唐仁廉等二十名将领，并为阵亡的知府田芬、参将阳茂泰等六名官员请恤。另附片奏报：徽州官军战败后，太平军势力蔓延，前锋已窜入江西境内，后续部队仍在不断涌来。
金陵围城战事交由曾国荃全权负责，若城池侥幸攻克，将由曾国荃、彭玉麟、杨岳斌三人联名速报战况概要，以慰圣心。陕西汉中地区的发匪、捻匪流窜至湖北、河南境内，企图解金陵之围。长江上下游均需加强防御部署。另附片奏报：臣近日患呕吐眩晕之症，请准假一月在军营调养。又附片奏请：降职调任的布政使唐训方准假回乡祭扫祖墓。再附片奏请：浙江盐运使李榕暂缓赴任，留营继续剿匪。另专折奏报：已将杨复成依法处决。
二十七日，曾国藩专折上奏，叩谢朝廷给予京察优叙的恩典。当日接到军机处寄来的谕旨：“总理衙门奏请将原定拨付轮船经费的五十余万两白银改解京师，现决定先行拨付金陵军营，用于发放军饷。”
二十八日，曾国藩审核确定了淮北票盐管理章程。
本月，左宗棠率军攻克武康、德清、石门三座县城。江西官军收复新城县，太平军残部逃入福建境内。
陕西太平军联合捻军进犯湖北，成大吉在樊城阻击敌军并获胜。败退的太平军流窜至河南境内。西安将军、忠勇公多隆阿在盩厔军营去世。
四月初三日，曾国藩设立书局，制定刊印书籍章程。江南、浙江自宋代以来就是文化昌盛之地，士绅家中多有藏书，刻版印刷十分精良，但经历战乱后，书籍损毁殆尽。曾国藩招募刻工，在安庆设立书局，陆续刊印经史典籍，聘请饱学之士汪士铎、莫友芝、刘毓松、张文虎等人分别负责校勘工作。初九日，彭玉麟到安庆拜见曾国藩，随后前往九江布防。
十二日，曾国藩紧急上奏：徽州防军作战失利，未能阻止太平军西窜，请求朝廷对自己严加处分；唐义训、毛有铭分别予以革职降级处分；为阵亡将领金茂荣、李祖祥等十三人请求抚恤。另专折奏报鲍超部收复金坛县，随折保举游击张遇春一人，并为阵亡将领鲍昌龄、宋连升、王正礼请求抚恤。
另有一折奏报江北地区已全部肃清，提督李世忠遣散所部兵勇，并陆续交出全椒、天长、来安、滁州、六合五座城池。李世忠呈请辞去官职，回乡安葬亲人，恳请朝廷恩准其解职归乡，以保全其声誉。所空缺的江南提督一职，恳请朝廷尽快选派合适人选接任，以重视军务要职。
另附片奏报：接到户部来文，称湖北、湖南、四川、江西、广东、江苏每月应协济臣营的军饷数额巨大。经核查，湖南省除东征局半厘外，并无奏定协饷款项。去年夏季虽曾奏请拨用江西洋税，但随即退还；广东厘金一事，是臣最为愧疚之处，然而本年该省仅解送过九万两饷银。
江苏厘金本属臣职责范围内应筹措的饷银，但本年该省仅解送过三万两。至于四川、湖北两省，则根本没有向臣营协解饷银的记录。户部所称六省供饷之事，不知依据何处奏报咨文，竟怀疑臣广揽财权、收支巨额款项。
臣才识平庸，却谬承重任，如今局势庞大，事务繁杂。论兵力，我军已成强弩之末；论粮饷，长久以来如同无米之炊。万一战事失利，臣如何担得起这般重责？恳请皇上降旨，将皖北军饷筹措之责交由乔松年、吴棠、富明阿共同承担；至于萧庆衍、毛有铭等部原由湖北供应的军饷，请饬令官文、严树森全力支应。若能使臣稍减筹措军饷之忧，实乃莫大幸事！
另附片奏报军情：围攻金陵的部队挖掘地道攻城，官兵伤亡近三千人，目前只能严密封锁、猛力进攻，以切断敌军补给；江西境内新窜入的太平军，可能再度侵扰内地；而捻军主力已突破随州、枣阳一带，意图借道安徽、湖北，东进增援金陵。
彭玉麟现已赶赴长江上游，负责江面防务，但皖北兵力薄弱，防务空虚令人担忧。另附片奏报江西南康知县石昌猷供词含糊不清，请革除其职务以便严加审讯。
十四日，丹阳的太平军向上游流窜，鲍超率军截击，大败敌军。常州的太平军窜入徽州境内，唐义训、毛有铭、金国琛率军截击并将其击溃，残余匪军逃往江西。
十九日，接到圣旨：“曾国藩奏报徽州军失利，自请严加议处一事，特加恩宽免。钦此。”又奉圣旨：“江南提督一职，由李朝斌补授。江南水师提督一职，由黄翼升补授；江南淮扬镇总兵员缺，由阳利见补授。钦此。”
二十七日，紧急上奏报告鲍超截击丹阳敌军取得大胜。另奏报苏州敌军继续流窜至徽州，官军进剿获胜，擒获斩杀及招降人数超过大半。附片奏称：苏浙一带敌军从徽州向上游流窜的，大致分为六股：第一股目前盘踞在江西南丰，并分兵窜入福建汀州境内；第二股侵扰铅山、湖坊等地；第三股曾进攻抚州，后撤退占据许湾；第四股被徽州守军击败，进入江西境内的残部人数不多；而广德、湖州两地敌军首领仍有两股，企图进犯徽州并窜入江西。当前军情以江西最为紧要。另上奏请求推迟江南地区本年乡试。
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