《大明电讯管理条例》颁布后，民间私自设立电台的现象得到一定遏制，但利用合法电台进行非法活动，以及密码破译与反破译的较量，却进入了白热化。
第一场重大胜利，是破获了一个利用商业电台密码漏洞，传递“白莲教”残余思想（号召反明复“宋”，实则图谋不轨）的秘密小团体。这个团体成员复杂，有对朝廷新政不满的旧式文人，有在工商业变革中失意的破落士绅，还有被煽动的少数工匠。他们使用一种自创的、基于《诗经》的简单替换密码，在金陵、苏州、杭州等地的商业电台间传递“密信”，内容涉及煽动抗税、散布朝廷“苛政”谣言、甚至探讨秘密结社的可能。
他们的活动起初并未引起注意，直到密电院一名年轻的译电员（痴迷密码学）在例行抽查商业电文时，发现几封往来于不同商号、内容看似正常贸易询价、但用词和句式有微妙规律的电报。他起了疑心，持续追踪，并利用频率分析和词频统计，最终成功破译了密码，发现了背后的阴谋。
靖安司立即介入，顺藤摸瓜，在金陵将这个秘密小团体一网打尽，主犯斩首，从犯流放。此案震动朝野，也证明了无线电管理的重要性。
然而，更隐蔽、更专业的挑战接踵而至。
一些实力雄厚的大商号，开始雇佣精通数学和语言的“清客”（幕僚），专门研究如何设置更复杂的密码保护自家商业情报，同时尝试破译竞争对手的密码。甚至出现了专门提供“密码编制与破译”服务的灰色行当。
更严重的是，发现了疑似外国间谍利用无线电活动的迹象。在靠近边境的河西、辽东、乃至广州的电台，偶尔会截获一些来源不明、使用未知密码的微弱信号。虽然暂时无法破译，但其出现的时间和规律，让人怀疑可能与境外势力有关。
密电院压力巨大。他们不仅要研发和维护军用的高级密码（定期更换），还要监控民用密码的使用，甄别可疑信号，并与民间“密码高手”和可能的间谍斗智斗勇。
贾诩向吕布汇报时，语气沉重：“陛下，电波无形，疆域无限。以往细作传递情报，需人携密信穿越关隘，极易截获。如今只需一台小小机器，万里之外，片刻即达。防谍之难，百倍于前。密电院人力有限，而天下聪明好奇之士、贪婪逐利之徒、乃至敌国奸细，何止万千？此乃心腹大患。”
吕布深知其中利害。来自现代的他，太清楚信息战和情报战的重要性。
“单靠防，是防不住的。”吕布道，“需攻防兼备。第一，密电院需扩大规模，从稷下学宫、格物院广招数学、语言、逻辑方面的奇才，待遇从优。不仅要编密码，更要研究如何快速破译密码。”
“第二，设立‘电波侦听站’。在边疆、沿海、重要城市外围，建立专门的站点，配备最灵敏的接收设备，不分昼夜监听所有可疑频率，记录所有不明信号，建立档案。”
“第三，施行‘电台登记与巡检’制度。所有公私电台，必须详细登记地点、功率、用途、操作人员。靖安司可随时进行突击检查，核查设备、人员、收发记录。”
“第四，也是最重要的，”吕布目光锐利，“我们要掌握最先进的密码技术。命格物院和密电院，成立‘密学研究组’，专门研究密码的本质。不要局限于文字替换，可以探索基于数学原理的、更复杂的加密方式，比如……用数字代替字母，进行复杂的数学运算加密。”（他隐晦地提到了近代密码学的雏形）
“第五，对外示警。将破获白莲教密电案公之于众，明确告知天下，朝廷有能力监控和破译非法电讯，胆敢利用此技作奸犯科者，必遭严惩！”
一系列组合拳打出，无线电领域的“无形硝烟”暂时被压制下去，但所有人都知道，这场在高维信息空间里的暗战，将随着技术的普及和利益的驱动，长期而隐蔽地进行下去。
思想领域的管控同样不轻松。“文华宣讲所”和《华夏精神读本》引发的辩论在“百家讲坛”的引导下渐趋理性，但各种非主流思想（包括外来宗教的变种、对实学的极端解读、怀旧的复古思潮等）仍在民间，特别是借助刚刚兴起的大众阅读（廉价印刷术普及）和口耳相传，悄悄滋生。
朝廷的应对是“疏导”与“建设”并重。一方面，允许在登记和审查的前提下，刊印不同学派的书籍（包括部分删节后的外来宗教典籍），提供给稷下学宫和大型图书馆收藏研究，供学者批判讨论，但不允许大规模公开传播煽动性内容。另一方面，加大力度推广《华夏精神读本》（修订版）和“文华宣讲所”，并组织编写一系列通俗易懂的、宣扬新价值观的戏剧、评话、唱本，与民间娱乐结合，潜移默化地影响大众。
吕布对负责此事的徐庶说：“思想如水，堵则溃，疏则通。我们要做的，是挖掘一条又深又宽的主流河道，让大多数水自然流向我们希望的方向。同时，在岸边设立警示牌和疏导渠，防止危险的支流和泛滥。至于那些地下的暗流……就让靖安司去处理吧。”
治理一个急速扩张、信息开始爆炸的全球性帝国，其复杂性远超单纯的军事征服。吕布和他的臣子们，正在前所未有的领域，摸索着新时代的统治艺术。
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