达才三仿佛从未存在过。鲛崎组长不甘地捶打墙壁，怒吼道：“他真的住在这间房间，我说这点绝对不会错的！”
他让毛利负责上层，自己则冲到下层甲板继续寻找。
与此同时，为了不引起恐慌并观察乘客，服部平次、小兰和柯南则与几位乘客——鲸井定雄、蟹江是久、龟田照吉以及海老名稔——在休息室玩起了扑克牌。
牌局中，柯南和平次都敏锐地注意到，鲸井定雄表现得异常紧张。
他不时地看表，对时间的流逝显得极度焦虑，额头上甚至渗出了细密的汗珠。
当平次似笑非笑地问他：“我说你知道现在几点了吗？……我发现你好像一直很在意时间啊，是不是有什么事呀？”
鲸井只是含糊地搪塞：“呃，因为明天呢是一个很重要的日子……” 他的反常举止，与其他看似悠闲的乘客形成了鲜明对比。
时间一分一秒地流逝，距离午夜12点越来越近。鲛崎组长和毛利小五郎的搜索一次次无功而返，他们找遍了船舱、甲板、机房，询问服务生，却得不到任何关于达才三的有效线索。
当时钟的指针无情地划过12点，宣告法律追诉期正式结束时，鲛崎组长颓然地靠在酒吧的椅子上，脸上写满了20年追捕付诸东流的绝望、不甘与深深的疲惫。
他苦笑着对毛利说：“毛利，我们再也不能够碰这件案子了……这样说起来，我在两年前就辞了刑警的工作，早就没这个资格了。”
空气中弥漫着功败垂成的沉重气氛。两人决定借酒浇愁，试图麻痹这巨大的失落感。
然而，就在这看似一切已然落幕，罪恶即将被时间赦免的时刻，真正的、血腥的序幕才刚刚拉开。
午夜12点08分，一声清脆得令人心悸的枪响，猛地撕裂了海上宁静的夜空！
所有人都被这声枪响惊动，纷纷冲向甲板。
众人只看到:轮船旁的其中一条救生艇燃起了熊熊大火，而火焰中隐约浮现一个人影，是龟田，。
有一张旧钞票，被一把匕首定在船的围栏上。上面写着一行触目惊心、仿佛来自地狱的字句：
“海神波塞顿又赋予了我性命，我的影子也将再度复活。”
“黑影计划师”达才三的犯罪宣言，以最血腥、最直接的方式，重现人间！
混乱尚未平息，接二连三的爆炸声再次从船尾传来！
众人赶到现场，只见救生艇和重要的通讯设备在爆炸中化为碎片和火焰。
“交响乐号”的动力系统受损，瞬间成了一座漂浮在茫茫大海上的、与外界完全失去联系的孤岛。恐慌如同瘟疫般在剩余的乘客中蔓延。
就在毛利、鲛崎努力维持秩序，组织灭火和检查损失时，第二个悲剧悄然而至。
蟹江是久被发现死在了机房附近，他是中枪身亡。
现场同样发现了旧钞。
调查中，柯南和平次凭借敏锐的观察力，发现蟹江的尸体上有被太阳晒出的泳裤痕迹，但肩膀处却有一块不自然的白皙皮肤。
这关键的细节暗示，他生前曾长时间穿着某种遮住肩膀的制服（例如船长的制服）。
结合两个现场的线索，柯南与平次通过默契的配合与推理，逐渐揭开了第一个案件的惊人真相。
他们向众人（主要由毛利小五郎转述）揭示：
最初在甲板上被烧焦的尸体，其实并非鲸井定雄，而是蟹江是久！
凶手（即鲸井定雄本人）利用了一个“金蝉脱壳”之计。
他先杀害了龟田照吉和蟹江是久，然后为龟田换上蟹江的衣服、戴上自己的手表，并点燃尸体，让所有人先入为主地认为“蟹江”已经死了。
然后，他继续隐藏在暗处，伺机进行接下来的计划。
而那张写有字的钞票，正是他自己留下的，为了将警方的视线引向“复活”的达才三，混淆视听。
这个计划的目的是什么？随着调查的深入，20年前的真相被一点点拼凑起来。
原来，当年的4亿元劫案，达才三确实有四位同伙：鲸井定雄、蟹江是久、龟田照吉以及矶贝渚的父亲（达才三）。
在最后分赃时，这四人见财起意，违背了达才三“不杀人”的原则，企图杀害他以独占巨款。
他们向达才三开枪，坠海身亡。
而这三人则带着赃款各自逃亡，相互猜忌，度过了20年胆战心惊的逃亡生涯。
然而，推理并未结束。
鲸井是凶手，并且杀害同伙蟹江和龟田的动机，显然是为了独吞剩余的赃款，并彻底摆脱过去的阴影。
一开始众人陷入误区，都以为不见了的蟹江是久才是杀害龟田的凶手。
那么蟹江人呢？在众人说话之际，从船板处突然被人扣下扳机，鲸井被射中了肩膀。
等到众人赶到时，只看到已经用枪自杀的蟹江是久。大家都以为西江19是准备在杀害鲸井之后，在无处可逃之际绝望自杀。
就在众人思考鲸井藏身之处时，船尾再次传来喧哗——放置紧急用救生艇的箱子着火了！
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